| Transcript Name | Strand | Ig Size (nt) | From (bp) | To (bp) | Left Gene | Right Gene | Experiments | Cluster | Information |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C0002 | w | 81 | 255 | 337 | thrL | thrA | 1;2;5;11;13 | D | |
| C0005 | w | 88 | 14079 | 14168 | dnaK | dnaJ | 2;4;6;7;8;10;12 | 5UTR | D |
| C0007 | w | 59 | 18655 | 18715 | nhaA | nhaR | 12 | 3UTR | P |
| C0012 | w | 42 | 22348 | 22391 | ribF | ileS | 2;3;7;8;11;12;13 | Gene | D |
| C0013 | w | 124 | 25701 | 25826 | lspA | slpA | 2;3;5;7;8;11;12;13 | Operon | D |
| C0017 | c | 52 | 54702 | 54755 | surA | imp | 2;3;7;8;11;12 | 3UTR | P |
| C0028 | c | 92 | 83529 | 83622 | leuA | leuL | 8;10;11 | 5UTR | D |
| C0030 | w | 60 | 105244 | 105305 | ftsA | ftsZ | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0031 | w | 100 | 106456 | 106557 | ftsZ | lpxC | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | P |
| C0034 | w | 160 | 122856 | 123017 | pdhR | aceE | 7 | 3UTR | D |
| C0035 | w | 324 | 127587 | 127912 | aceF | lpdA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0037 | w | 127 | 134212 | 134340 | acnB | yacL | 8 | P | |
| C0038 | c | 36 | 160112 | 160149 | yadB | dksA | 12 | P | |
| C0039 | c | 177 | 160604 | 160782 | dksA | sfsA | 2;3;4;5;8;10;11;12 | 3UTR | D / ORF 75 |
| C0043 | w | 81 | 176528 | 176610 | yadQ | yadR | 2;3;4;5;8;9;10;11;12 | Gene | P |
| C0046 | c | 30 | 185947 | 185978 | dapD | glnD | 3;11 | Gene | P |
| C0048 | w | 257 | 190599 | 190857 | rpsB | tsf | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0050 | w | 146 | 191708 | 191855 | tsf | pyrH | 2;3;11;13 | Operon | P |
| C0051 | w | 291 | 192580 | 192872 | pyrH | frr | 3;11 | P / ORF 87 | |
| C0053 | w | 91 | 193429 | 193521 | frr | yaeM | 2;11;12 | P | |
| C0054 | w | 185 | 194717 | 194903 | yaeM | yaeS | 2;8 | P | |
| C0055 | w | 120 | 195664 | 195785 | yaeS | cdsA | 2;8;11;12;13 | P | |
| C0056 | w | 121 | 200360 | 200482 | yaeT | hlpA | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0058 | w | 104 | 201996 | 202101 | lpxD | fabZ | 2;8;11;12 | Gene | P |
| C0059 | w | 36 | 205089 | 205126 | rnhB | dnaE | 12 | 3UTR | P |
| C0060 | w | 64 | 212266 | 212331 | yaeR | mesJ | 7;11;12 | 3UTR | P / RT-PCR |
| C0062 | c | 111 | 218775 | 218887 | proS | yaeB | 2;8 | P | |
| C0063 | c | 39 | 220928 | 220968 | yaeC | yaeE | 1;2;3;7;11 | 5UTR | P |
| C0064 | w | 362 | 223408 | 223771 | yaeD | rrsH | 7;10;11 | Operon candidate | |
| C0068 | w | 205 | 244121 | 244327 | gmhA | yafJ | 2 | Gene | P / ORF 90 |
| C0069 | c | 155 | 245805 | 245961 | yafK | yafQ | 2;7;11 | Gene | P |
| C0075 | w | 606 | 271479 | 272086 | b0257 | ykfC | 2;3 | P / ORF 120 | |
| C0084 | c | 76 | 366734 | 366811 | lacI | mhpR | 12 | P | |
| C0089 | w | 49 | 406153 | 406203 | aroL | yaiA | 2;7;8 | D | |
| C0092 | w | 55 | 425305 | 425361 | queA | tgt | 2;3;5;7;8;9;11;12;13 | Operon | D |
| C0094 | w | 88 | 433782 | 433871 | ribD | ribH | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | P |
| C0101 | w | 343 | 454013 | 454357 | bolA | tig | 2;3 | 5UTR | P |
| C0104 | w | 125 | 456524 | 456650 | clpP | clpX | 2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | D | |
| C0115 | w | 52 | 493247 | 493300 | dnaX | ybaB | 2;8;12 | Gene | P |
| C0122 | w | 124 | 513092 | 513217 | ybaT | ybbI | 8;10;12 | 5UTR | P |
| C0136 | w | 217 | 613162 | 613380 | fes | entF | 2;3;7;8;9;11 | 3UTR | D |
| C0141 | w | 180 | 628936 | 629117 | ybdB | cstA | 2;3;6;7;8;9;11 | P | |
| C0144 | w | 214 | 638731 | 638946 | ahpC | ahpF | 12 | Operon | D |
| C0146 | c | 229 | 643190 | 643420 | rnk | rna | 8 | 3UTR | P |
| C0151 | c | 109 | 661865 | 661975 | ybeD | dacA | 2 | 3UTR | P |
| C0152 | c | 138 | 663186 | 663325 | dacA | rlpA | 2 | P | |
| C0153 | c | 30 | 667440 | 667471 | mrdA | ybeA | 3;7;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0160 | c | 89 | 691007 | 691097 | ybeX | ybeY | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 3UTR | P |
| C0174 | w | 274 | 761962 | 762237 | sucB | sucC | 2;3;5;6;7;8;9;12;13 | Operon | D |
| C0177 | w | 127 | 773404 | 773532 | cydB | ybgE | 1;2;5;8;10;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0178 | w | 64 | 775500 | 775565 | tolR | tolA | 1;2;3;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0179 | w | 132 | 776830 | 776963 | tolA | tolB | 7;8;11;12 | 3UTR | D |
| C0181 | w | 34 | 778255 | 778290 | tolB | pal | 1;2;3;5;8;11;13 | 5UTR | P |
| C0195 | c | 125 | 844838 | 844964 | ybiO | glnQ | 2 | P | |
| C0196 | c | 138 | 846342 | 846481 | glnP | glnH | 2;3;11 | D | |
| C0204 | w | 110 | 877854 | 877965 | b0836 | yliI | 4 | Operon | P |
| C0208 | w | 40 | 897700 | 897741 | ybjO | ybjF | 12 | P | |
| C0210 | c | 36 | 908517 | 908554 | ybjU | poxB | 2;7;8;10;12 | Gene | P |
| C0214 | w | 30 | 922456 | 922487 | yljA | clpA | 1;2;3;8;10;11 | 3UTR | P |
| C0219 | c | 41 | 926655 | 926697 | aat | cydC | 11 | P | |
| C0223 | w | 90 | 938560 | 938651 | ycaJ | serS | 2;8;12;13 | P | |
| C0226 | w | 70 | 957964 | 958035 | serC | aroA | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12 | Operon | D |
| C0228 | w | 110 | 961107 | 961218 | cmk | rpsA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0229 | w | 159 | 962891 | 963051 | rpsA | himD | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0232 | w | 51 | 969844 | 969896 | ycaQ | ycaR | 2 | Operon | P |
| C0241 | c | 168 | 988208 | 988377 | asnS | pncB | 3 | P | |
| C0245 | w | 129 | 1011094 | 1011224 | uup | pqiA | 4 | 3UTR | P |
| C0247 | c | 68 | 1015693 | 1015762 | fabA | b0955 | 2;4;8;12 | P | |
| C0256 | w | 184 | 1039655 | 1039840 | appB | appA | 12 | D / ORF 90 | |
| C0269 | w | 54 | 1098047 | 1098102 | ycdW | ycdX | 2 | 3UTR | P |
| C0270 | w | 53 | 1099417 | 1099471 | ycdY | ycdZ | 2;13 | P | |
| C0280 | w | 110 | 1146763 | 1146874 | rpmF | plsX | 2;5;7;8;11;12;13 | Operon | P / Reg RhaS |
| C0281 | w | 67 | 1147914 | 1147982 | plsX | fabH | 12 | Operon | P |
| C0282 | w | 210 | 1150627 | 1150838 | fabG | acpP | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | P |
| C0284 | w | 87 | 1151074 | 1151162 | acpP | fabF | 2;12;13 | P | |
| C0287 | w | 209 | 1166612 | 1166822 | ndh | ycfJ | 2 | P | |
| C0290 | c | 35 | 1191854 | 1191890 | ycfC | ycfB | 12;13 | 5UTR | P |
| C0298 | w | 71 | 1227230 | 1227302 | ycgL | b1180 | 2 | 5UTR | P |
| C0306 | c | 150 | 1261098 | 1261249 | prsA | ychB | 2;3;6;7;8;11;12;13 | Operon | P |
| C0309 | w | 35 | 1267352 | 1267388 | ychA | kdsA | 2;3;7;8;12;13 | 5UTR | P |
| C0311 | w | 136 | 1271572 | 1271709 | chaB | chaC | 2;3;4;8;9;10;11;12 | D | |
| C0315 | c | 49 | 1287847 | 1287897 | purU | ychJ | 2;3;8;11;12 | P | |
| C0317 | w | 201 | 1290478 | 1290680 | hnr | galU | 2;3;12 | P / RT-PCR | |
| C0322 | w | 85 | 1300837 | 1300923 | oppA | oppB | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | D |
| C0324 | c | 85 | 1313794 | 1313880 | yciF | yciG | 10 | 3UTR | P |
| C0330 | w | 148 | 1338118 | 1338267 | pgpB | yciS | 2 | 3UTR | P |
| C0334 | c | 67 | 1346936 | 1347004 | rnb | yciW | 2;3;5;6;7;8;9;11;12 | Operon | P |
| C0338 | w | 53 | 1366771 | 1366825 | pspA | pspB | 2;11 | Operon | D |
| C0339 | w | 74 | 1367638 | 1367713 | pspD | pspE | 4 | Operon | D |
| C0354 | w | 62 | 1496899 | 1496962 | ydcH | rimL | 2;3 | 5UTR | P |
| C0360 | c | 81 | 1540614 | 1540696 | narZ | narU | 12 | P | |
| C0363 | c | 67 | 1550784 | 1550852 | yddM | adhP | 4;10 | P | |
| C0366 | c | 101 | 1553987 | 1554089 | rpsV | b1481 | 2;3;6;7;8;10;11;12 | 5UTR | P |
| C0368 | c | 155 | 1568513 | 1568669 | xasA | gadB | 2;3;6;7;8;9;10;12 | Operon | P |
| C0370 | c | 37 | 1575643 | 1575681 | yddB | yddA | 2 | 3UTR | P |
| C0371 | c | 43 | 1592089 | 1592133 | b1509 | ydeK | 2;5;8;9;11 | 5UTR | P |
| C0385 | c | 71 | 1643298 | 1643370 | relF | relE | 2;5;8;11 | Gene | P |
| C0391 | w | 34 | 1654173 | 1654208 | b1583 | speG | 2;3;8;12 | Operon | P |
| C0402 | c | 128 | 1715246 | 1715375 | tyrS | pdxH | 2;7;8;12 | P | |
| C0411 | c | 148 | 1756749 | 1756898 | ynhG | ynhA | 2;3;7;8;10;11;12 | P | |
| C0416 | w | 156 | 1786302 | 1786459 | ydiA | aroH | 7 | Operon | P |
| C0418 | c | 62 | 1792133 | 1792196 | btuE | btuC | 2;11 | 5UTR | D |
| C0419 | c | 283 | 1796966 | 1797250 | pheS | pheM | 72;;8;9;12 | D | |
| C0422 | c | 96 | 1798023 | 1798120 | rpmI | infC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | D |
| C0426 | w | 105 | 1805714 | 1805820 | b1724 | b1725 | 1;2;3;5;8;9;10;11;12 | Operon | P |
| C0428 | c | 116 | 1846032 | 1846149 | selD | ydjA | 2;3;7;8;10;12;13 | Gene | D |
| C0433 | w | 112 | 1866866 | 1866979 | yeaG | yeaH | 2;3;4;5;8;10;11;12 | 3UTR | P |
| C0438 | w | 62 | 1901043 | 1901106 | manX | manY | 2;12;13 | Operon | D |
| C0442 | c | 675 | 1912979 | 1913655 | yebJ | b1832 | 2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | P | |
| C0450 | c | 54 | 1928426 | 1928481 | yebF | yebG | 2;8;11 | 5UTR | P |
| C0451 | c | 36 | 1930780 | 1930817 | eda | edd | 2;3;7;8;12;13 | P | |
| C0454 | w | 127 | 1935545 | 1935673 | yebK | pykA | 2;8;12;13 | P | |
| C0457 | c | 78 | 1939596 | 1939675 | yebA | yebL | 1;2;3;4;5;7;11 | Operon | P |
| C0460 | c | 34 | 1945400 | 1945435 | ruvC | yebC | 2;8;12 | 3UTR | P |
| C0461 | c | 117 | 1946656 | 1946774 | ntpA | aspS | 2;3;8;12 | Operon | P |
| C0472 | c | 62 | 1992663 | 1992726 | uvrC | uvrY | 2;3;4;5;7;8;11;12;13 | P | |
| C0475 | c | 155 | 2026054 | 2026210 | b1956 | b1957 | 2 | P | |
| C0477 | c | 39 | 2031101 | 2031141 | yedJ | b1963 | 1;2;3;6;7;8;9;10;11;12 | Operon | P |
| C0484 | w | 101 | 2052981 | 2053083 | shiA | amn | 8;11 | Operon | P |
| C0491 | c | 260 | 2085090 | 2085351 | yeeF | yeeY | 2 | 3UTR | P |
| C0493 | c | 57 | 2109041 | 2109099 | rfbA | rfbD | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | D |
| C0495 | c | 174 | 2112349 | 2112524 | galF | wcaM | 2 | P / ORF 84 | |
| C0497 | c | 91 | 2140237 | 2140329 | dcd | udk | 11 | 5UTR | D |
| C0500 | c | 99 | 2169755 | 2169855 | gatR | gatD | 5;8;11;13 | Operon | D |
| C0501 | c | 30 | 2172586 | 2172617 | gatB | gatA | 2;4;5;8;11;12;13 | Operon | D |
| C0530 | w | 233 | 2345170 | 2345404 | nrdA | nrdB | 2;3;5;8;9;10;11;13 | D | |
| C0537 | c | 186 | 2389345 | 2389532 | nuoN | nuoM | 12;13 | Operon | D |
| C0539 | c | 163 | 2391061 | 2391225 | nuoM | nuoL | 2;8;12;13 | Operon | D |
| C0540 | c | 46 | 2398191 | 2398238 | nuoG | nuoF | 12;13 | Operon | D |
| C0541 | c | 93 | 2401877 | 2401971 | nuoC | nuoB | 12;13 | Operon | D |
| C0547 | w | 74 | 2412692 | 2412767 | ackA | pta | 11;12;13 | 5UTR | P |
| C0548 | c | 57 | 2417196 | 2417254 | b2299 | yfcE | 8 | 5UTR | P |
| C0553 | c | 36 | 2428258 | 2428295 | purF | cvpA | 2;6;7;8;11;12 | Operon | D |
| C0554 | c | 258 | 2428783 | 2429042 | cvpA | dedD | 2;8;11 | 5UTR | D |
| C0555 | c | 155 | 2431946 | 2432102 | accD | dedA | 2 | Operon | P |
| C0556 | c | 82 | 2432761 | 2432844 | dedA | truA | 2;8;11 | Gene | P |
| C0557 | c | 65 | 2434669 | 2434735 | usg | pdxB | 8;11 | 5UTR | P |
| C0560 | c | 33 | 2442189 | 2442223 | b2325 | b2326 | 2;3;7;8;11;12 | Gene | P |
| C0561 | c | 34 | 2445493 | 2445528 | aroC | yfcB | 1;2;3;5;6;7;8;9;11;12;13 | Operon | P |
| C0576 | c | 70 | 2528196 | 2528267 | lig | zipA | 2 | 3UTR | P |
| C0580 | w | 44 | 2532041 | 2532086 | ptsH | ptsI | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D / RT-PCR |
| C0581 | w | 40 | 2533813 | 2533854 | ptsI | crr | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0583 | w | 32 | 2535736 | 2535769 | yfeK | b2420 | 2;4;8;10 | 5UTR | P |
| C0585 | c | 133 | 2537603 | 2537737 | cysM | cysA | 11 | Operon | D |
| C0586 | c | 425 | 2539273 | 2539699 | cysW | cysU | 2;5;11 | Operon | D |
| C0590 | c | 68 | 2548592 | 2548661 | b2431 | b2432 | 2;8;9 | Operon | P |
| C0600 | c | 167 | 2594757 | 2594925 | b2475 | purC | 7;11;12 | 3UTR | P |
| C0603 | c | 49 | 2616841 | 2616891 | b2496 | uraA | 11 | 3UTR | P |
| C0604 | c | 85 | 2618180 | 2618266 | uraA | upp | 7;11 | 3UTR | D |
| C0605 | c | 68 | 2630555 | 2630624 | guaA | guaB | 6;7;8;11;12 | 3UTR | D |
| C0606 | c | 33 | 2633870 | 2633904 | b2510 | b2511 | 2;8 | Gene | P |
| C0607 | c | 78 | 2635415 | 2635494 | b2511 | b2512 | 2;3;8;12;13 | P | |
| C0608 | c | 110 | 2638595 | 2638706 | hisS | gcpE | 5;8;11;12 | 5UTR | P |
| C0611 | c | 284 | 2640864 | 2641149 | yfgA | yfgB | 2;3;11;12 | Gene | P / ORF 87 |
| C0615 | c | 132 | 2652962 | 2653095 | sseB | pepB | 2;3;7;8;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0616 | c | 90 | 2654465 | 2654556 | pepB | yfhJ | 2;7;8 | P | |
| C0617 | c | 95 | 2657487 | 2657583 | yfhE | yfhF | 6;7;12 | 5UTR | P |
| C0618 | c | 87 | 2659575 | 2659663 | yfhO | b2531 | 2;3;4;6;7;8;12;13 | 5UTR | P |
| C0619 | c | 451 | 2660151 | 2660603 | b2531 | b2532 | 12 | P | |
| C0621 | c | 60 | 2685428 | 2685489 | glnB | yfhA | 2;11 | 3UTR | P |
| C0628 | c | 197 | 2705144 | 2705342 | lepA | rseC | 11 | Gene | P |
| C0629 | c | 32 | 2707424 | 2707457 | rseA | rpoE | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | D | |
| C0631 | w | 110 | 2720633 | 2720744 | yfiQ | pssA | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0632 | w | 96 | 2722102 | 2722199 | pssA | yfiM | 12 | 5UTR | P |
| C0638 | w | 34 | 2735139 | 2735174 | b2596 | yfiA | 2;3 | Gene | P |
| C0640 | w | 98 | 2735666 | 2735765 | pheL | pheA | 2;3;4;5;8;9;10;11 | Gene | D |
| C0641 | c | 41 | 2742550 | 2742592 | rplS | trmD | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | D | |
| C0642 | c | 248 | 2744205 | 2744454 | rpsP | ffh | 2;5;8;11;12;13 | Gene | P |
| C0654 | w | 57 | 2805095 | 2805153 | proW | proX | 2;7;8 | Operon | D |
| C0657 | c | 150 | 2812754 | 2812905 | ygaG | gshA | 12 | P | |
| C0658 | c | 72 | 2814461 | 2814534 | gshA | b2689 | 8 | P | |
| C0662 | w | 104 | 2826539 | 2826644 | srlD | gutM | 13 | Operon | D |
| C0663 | w | 31 | 2827843 | 2827875 | srlR | gutQ | 13 | Operon | D |
| C0666 | c | 124 | 2847872 | 2847997 | hycB | hycA | 7 | Operon | D |
| C0667 | w | 38 | 2851280 | 2851319 | hypD | hypE | 12 | 3UTR | D |
| C0668 | c | 62 | 2865574 | 2865637 | rpoS | nlpD | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | D |
| C0669 | c | 139 | 2866776 | 2866916 | nlpD | pcm | 2;3;8;12 | Gene | Operon candidate |
| C0671 | c | 49 | 2871360 | 2871410 | ygbE | cysC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;11;12 | Operon | P |
| C0672 | c | 74 | 2886335 | 2886410 | cysH | cysI | 1;2;4;5;6;7;8;11;12 | Operon | D |
| C0675 | c | 87 | 2905963 | 2906051 | eno | pyrG | 1;2;3;4;5;7;8;10;11;12;13 | P | |
| C0677 | c | 227 | 2907688 | 2907916 | pyrG | mazG | 2 | P | |
| C0678 | c | 47 | 2911673 | 2911721 | relA | ygcA | 2;5;8 | Operon | P |
| C0686 | c | 175 | 2956906 | 2957082 | ptr | recC | 2;8 | P | |
| C0692 | c | 166 | 3034302 | 3034393 | prfB | recJ | 8;11;12 | 5UTR | P |
| C0697 | c | 118 | 3047061 | 3047180 | gcvP | gcvH | 12;13 | Operon | D |
| C0702 | c | 214 | 3069264 | 3069479 | fba | pgk | 2;3;7;8;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0704 | c | 49 | 3070642 | 3070692 | pgk | epd | 1;2;3;4;5;7;8;10;11;12;13 | Gene | D |
| C0709 | c | 137 | 3081816 | 3081954 | speB | speA | 2;3;12 | 3UTR | D |
| C0713 | c | 182 | 3099642 | 3099825 | yggN | yggL | 2;3;8 | 3UTR | P |
| C0716 | w | 61 | 3102386 | 3102448 | yggX | mltC | 2;11 | Gene | P |
| C0722 | w | 139 | 3151438 | 3151578 | metC | yghB | 2;3;8;11 | P | |
| yqhE | w | 221 | 3154532 | 3154754 | yqhD | yqhE | 2;3;8;9;10;12 | Gene | P / yqhE (colibri) |
| C0725 | w | 30 | 3171127 | 3171158 | mdaB | ygiN | 2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0731 | c | 47 | 3194394 | 3194442 | b3052 | glnE | 12 | Gene | P |
| C0735 | w | 110 | 3208637 | 3208748 | rpsU | dnaG | 2;8;11 | D | |
| C0744 | w | 37 | 3246977 | 3247015 | yqjC | yqjD | 2;3;4;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | P |
| C0750 | c | 128 | 3305552 | 3305681 | deaD | yhbM | 28 | 5UTR | P |
| C0752 | c | 108 | 3306565 | 3306674 | yhbM | pnp | 1;2;3;5;6;7;8;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0753 | c | 177 | 3308878 | 3309056 | pnp | rpsO | 7 | D | |
| C0755 | c | 163 | 3310819 | 3310983 | rbfA | infB | 1;2;3;5;7;8;9;11;12;13 | P | |
| C0761 | c | 44 | 3322597 | 3322642 | folP | hflB | 2 | 3UTR | P |
| C0762 | c | 99 | 3324576 | 3324676 | hflB | ftsJ | 2;4;8;12 | 3UTR | D |
| C0769 | c | 54 | 3334135 | 3334190 | murA | yrbA | 2;7;8;11;12 | D | |
| C0771 | w | 47 | 3342310 | 3342358 | yhbG | rpoN | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0773 | c | 220 | 3348109 | 3348330 | yhbL | arcB | 8;12 | P | |
| C0776 | c | 78 | 3370239 | 3370318 | nanT | nanA | 13 | Operon | P |
| C0784 | c | 67 | 3393895 | 3393963 | yhdR | cafA | 11 | 5UTR | P |
| C0785 | c | 65 | 3397615 | 3397681 | mreC | mreB | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0786 | c | 244 | 3398784 | 3399029 | mreB | yhdA | 1;2;4;9;12 | P / ORF 117 | |
| C0791 | c | 62 | 3429566 | 3429629 | yrdD | smg | 2 | 3UTR | P |
| C0793 | c | 40 | 3437636 | 3437677 | rplQ | rpoA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | D |
| C0794 | c | 146 | 3440108 | 3440255 | rpsM | rpmJ | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | Operon candidate |
| C0796 | c | 31 | 3440371 | 3440403 | rpmJ | prlA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | D |
| C0797 | c | 33 | 3444182 | 3444216 | rpsH | rpsN | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0798 | c | 164 | 3445786 | 3445951 | rplN | rpsQ | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | Operon candidate |
| C0800 | c | 32 | 3450563 | 3450596 | rplC | rpsJ | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | D |
| C0801 | c | 237 | 3450907 | 3451145 | rpsJ | pinO | 1;2;3;5;8;10;11 | 5UTR | P / ORF 84 |
| C0804 | c | 71 | 3464362 | 3464434 | bfr | yheA | 2;8;11 | P | |
| C0805 | c | 70 | 3467490 | 3469037 | yheB | fusA | 2;4;5;8;10;11 | D | |
| C0806 | c | 96 | 3471718 | 3471815 | rpsG | rpsL | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C0808 | c | 125 | 3472189 | 3472315 | rpsL | yheL | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 3UTR | P |
| C0809 | c | 154 | 3474089 | 3474244 | yheO | fkpA | 2;12 | 3UTR | P |
| C0812 | c | 304 | 3476134 | 3476439 | slyD | kefB | 2;11 | P | |
| C0814 | w | 53 | 3482073 | 3482127 | yheU | prkB | 9;12 | P | |
| C0820 | c | 106 | 3513551 | 3513658 | dam | damX | 2;5;8;11;12 | Operon | D |
| C0821 | c | 91 | 3514944 | 3515036 | damX | aroB | 12 | Gene | D |
| C0822 | c | 56 | 3516124 | 3516181 | aroB | aroK | 2;8;11;12;13 | Operon | D |
| C0831 | c | 272 | 3571135 | 3571408 | glgB | asd | 2;3;5;8;11;12 | P | |
| C0836 | c | 122 | 3577276 | 3577399 | yhhW | yhhX | 2 | 3UTR | P |
| C0843 | w | 54 | 3610545 | 3610600 | yhhT | yhhU | 2;12 | 5UTR | P |
| C0854 | c | 63 | 3653532 | 3653596 | yhiD | hdeB | 7;8;12 | 5UTR | P |
| C0855 | c | 103 | 3653934 | 3654038 | hdeB | hdeA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12 | Gene | D |
| C0856 | w | 798 | 3655197 | 3655996 | hdeD | yhiE | 8;10 | 5UTR | P / ORF 81 |
| C0859 | w | 338 | 3656523 | 3656862 | yhiE | yhiU | 12 | 3UTR | P |
| C0866 | c | 35 | 3693590 | 3693626 | yhjQ | yhjR | 2 | 3UTR | P |
| C0869 | c | 307 | 3703419 | 3703727 | dppB | dppA | 2;8;11;12 | 3UTR | D |
| C0885 | c | 62 | 3781755 | 3781818 | secB | grxC | 2;5;8;12 | Operon | P |
| C0891 | c | 70 | 3797823 | 3797894 | rfaZ | rfaY | 2 | Gene | D |
| C0893 | c | 216 | 3809301 | 3809518 | rpmB | radC | 2;7;11;12;13 | P / ORF 75 | |
| C0895 | w | 64 | 3812014 | 3812079 | dut | ttk | 2;7;8;13 | Gene | P |
| C0896 | w | 54 | 3819678 | 3819733 | gmk | rpoZ | 2;7;8;12 | 5UTR | P |
| C0901 | c | 105 | 3864530 | 3864636 | ibpB | ibpA | 8 | Operon | D |
| C0905 | w | 223 | 3882481 | 3882705 | rnpA | yidC | 2;7;8;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0907 | w | 205 | 3886138 | 3886344 | tnaL | tnaA | 13 | Operon | D |
| C0908 | w | 90 | 3887774 | 3887865 | tnaA | tnaB | 13 | Operon | D |
| C0909 | c | 161 | 3911296 | 3911458 | glmS | glmU | 2;8;11;12;13 | Operon | D |
| C0911 | c | 50 | 3915893 | 3915944 | atpG | atpA | 1;2;3;5;8;11;12;13 | Operon | D |
| C0912 | c | 61 | 3918516 | 3918578 | atpF | atpE | 13 | Gene | D |
| C0914 | c | 63 | 3921308 | 3921372 | gidB | gidA | 11 | 5UTR | P |
| C0915 | c | 378 | 3923261 | 3923640 | gidA | mioC | 2;8;11;12 | 3UTR | P |
| C0920 | w | 139 | 3948043 | 3948183 | ilvL | ilvG | 2;3;7;8;11 | 5UTR | D |
| C0921 | w | 95 | 3951036 | 3951132 | ilvE | ilvD | 5;11 | Operon | D |
| C0922 | c | 135 | 3961844 | 3961980 | gppA | rhlB | 2;7;8;9;11;12;13 | Gene | P |
| C0923 | w | 84 | 3963947 | 3964032 | trxA | rho | 2;7;8;11;12;13 | P | |
| C0932 | w | 45 | 4024071 | 4024117 | yigC | ubiB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | P |
| C0935 | w | 38 | 4030696 | 4030735 | yigZ | trkH | 2;12 | Gene | P |
| C0936 | w | 163 | 4032033 | 4032197 | trkH | hemG | 2;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | P |
| C0963 | w | 60 | 4154368 | 4154429 | argB | argH | 2;3;11 | Operon | D |
| C0968 | w | 157 | 4175867 | 4176025 | nusG | rplK | 2;8;12;13 | Gene | P / RT-PCR |
| C0969 | w | 412 | 4177161 | 4177574 | rplA | rplJ | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Gene | P / RT-PCR |
| C0971 | w | 66 | 4178071 | 4178138 | rplJ | rplL | 2;7;8;12;13 | D / RT-PCR | |
| C0972 | w | 319 | 4178503 | 4178823 | rplL | rpoB | 2;3;4;5;6;7;8;10;11;12;13 | Gene | D / RT-PCR |
| C0974 | w | 76 | 4182851 | 4182928 | rpoB | rpoC | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D / RT-PCR |
| C0977 | c | 110 | 4190288 | 4190399 | thiG | thiF | 5;11 | D | |
| C0980 | w | 39 | 4195254 | 4195294 | yjaD | hemE | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5UTR | P |
| C0981 | w | 186 | 4197672 | 4197859 | yjaG | hupA | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | P | |
| C0983 | w | 182 | 4215992 | 4216175 | aceA | aceK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;11;12 | D | |
| C0986 | c | 252 | 4229210 | 4229463 | yjbD | lysC | 11;12 | P | |
| C0990 | c | 153 | 4242654 | 4242808 | malF | malE | 5;13 | 3UTR | D |
| C0991 | w | 71 | 4245478 | 4245550 | malK | lamB | 13 | Operon | D |
| C0995 | w | 52 | 4263308 | 4263361 | dnaB | alr | 2 | P | |
| C0998 | c | 199 | 4282792 | 4282992 | yjcH | acs | 4 | Operon | P |
| C1017 | w | 43 | 4368559 | 4368603 | mopB | mopA | 1;2;3;4;5;7;8;10;11;12 | Operon | P |
| C1024 | w | 85 | 4397780 | 4397866 | miaA | hfq | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | D |
| C1025 | w | 75 | 4398174 | 4398250 | hfq | hflX | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | Operon | D |
| C1026 | w | 85 | 4399530 | 4399616 | hflX | hflK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;11;12;13 | 3UTR | D |
| C1028 | w | 204 | 4403563 | 4403768 | purA | yjeB | 2 | P / RT-PCR | |
| C1032 | c | 121 | 4413897 | 4414019 | yjfN | yjfO | 2;3;4;5 | Operon | P |
| C1034 | w | 41 | 4423644 | 4423686 | rpsR | rplI | 2;3;5;7;8;11;12;13 | Gene | D / RT-PCR |
| C1041 | w | 137 | 4448495 | 4448633 | ytfQ | ytfR | 4 | Gene | P / RT-PCR |
| C1045 | w | 241 | 4456885 | 4457127 | pmbA | cybC | 2;8;10;12 | 3UTR | P |
| C1047 | c | 157 | 4457938 | 4458096 | nrdG | nrdD | 4;13 | Operon | P |
| C1050 | c | 49 | 4462283 | 4462333 | treC | treB | 13 | Operon | D |
| C1053 | c | 33 | 4468526 | 4468560 | yjgF | pyrI | 2;3;6;7;8;11;12 | Operon | P |
| C1055 | c | 159 | 4481848 | 4482008 | holC | pepA | 9;11;12 | 3UTR | P |
| C1063 | c | 86 | 4514245 | 4514332 | fecA | fecR | 2;7;11 | D | |
| C1074 | w | 36 | 4541835 | 4541872 | fimI | fimC | 2;3;7;8;9;11;12;13 | 3UTR | D |
| C1081 | c | 112 | 4586333 | 4586446 | yjiA | yjiX | 13 | Operon | P |
| C1085 | c | 45 | 4597761 | 4597807 | yjjA | dnaC | 12 | 3UTR | P |
| ytjA | w | 409 | 4609570 | 4609980 | osmY | yjjU | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3UTR | P / ytjA (colibri) / ORF 147 |
| C1093 | w | 126 | 4615671 | 4615798 | deoC | deoA | 2 | D | |
| C1094 | w | 56 | 4618395 | 4618452 | deoB | deoD | 2;3;12;13 | Operon | D |
| C1095 | w | 48 | 4623432 | 4623481 | serB | sms | 11 | P |