| Transcript Name | Strand | Ig Size (nt) | From (bp) | To (bp) | Size (nt) | Left Gene | Right Gene | Experiments | Expression | Cluster | Homology | E-value | Identiry (%) | Information |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C0001 | w | 189 | 134 | 168 | 34 | lasT | thrL | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 | 2045 | 1.3 | 100 | |||
| C0004 | w | 376 | 12049 | 12153 | 104 | yaaI | dnaK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13107 | Yes | 7.00E-18 | 91 | ||
| C0010 | c | 102 | 21078 | 21176 | 98 | rpsT | b0024 | 1;2;3;4;6;7;8;10;11;12;13 | 5491 | 5UTR | Yes | 2.00E-51 | 100 | |
| C0011 | w | 102 | 21083 | 21170 | 87 | rpsT | b0024 | 2;4;12 | 855 | Yes | 8.00E-45 | 100 | ||
| C0014 | w | 166 | 28286 | 28358 | 72 | yaaF | dapB | 2;3;8;9;10;11;12;13 | 6390 | 5UTR | Yes | 4.00E-06 | 100 | |
| C0015 | w | 455 | 29530 | 29612 | 82 | dapB | carA | 2;6;7;8;11 | 5087 | Yes | 1.00E-09 | 90 | ||
| C0018 | c | 254 | 57115 | 57240 | 125 | imp | yabH | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2413 | Yes | 4.00E-32 | 89 | ||
| C0019 | w | 294 | 58250 | 58448 | 198 | yabH | yabP | 2;3;8 | 553 | 5UTR | 0.18 | 100 | ||
| C0029 | w | 601 | 89359 | 89619 | 260 | fruR | yabB | 2;1;4;7;8;11 | 1686 | 5UTR | Yes | 2.00E-38 | 86 | |
| C0032 | w | 155 | 107505 | 107628 | 123 | lpxC | yacA | 2;3;5;6;7;8;9;11;12;13 | 2257 | Yes | 2.00E-06 | 94 | ||
| C0033 | c | 224 | 113247 | 113364 | 117 | yacE | guaC | 2;4 | 490 | Yes | 7.00E-06 | 100 | ||
| C0036 | w | 354 | 131505 | 131609 | 104 | yacH | acnB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9454 | 5UTR | Yes | 7.00E-21 | 95 | |
| C0041 | c | 224 | 174894 | 174991 | 97 | hemL | yadQ | 2;4;8;11;12;13 | 2140 | Yes | 1.00E-06 | 90 | ||
| C0044 | w | 129 | 180806 | 180882 | 76 | dgt | htrA | 2;3;4;11;12;13 | 1458 | Yes | 1.00E-15 | 89 | ||
| C0045 | c | 161 | 184095 | 184179 | 84 | yaeH | yaeI | 2;3;4 | 3006 | 0.27 | 100 | |||
| C0047 | w | 367 | 189608 | 189859 | 251 | map | rpsB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 15365 | 5UTR | Yes | 3.00E-68 | 93 | |
| C0061 | c | 352 | 213938 | 214162 | 224 | yaeO | yaeQ | 2;8;12;13 | 3409 | Yes | 2.00E-66 | 89 | ||
| C0071 | c | 260 | 255718 | 255813 | 95 | pepD | gpt | 2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 6427 | 1.3 | 100 | |||
| C0076 | c | 509 | 279314 | 279581 | 267 | b0263 | yagB | 3;7 | 871 | Yes | 2.00E-32 | 82 | IS 30 associated | |
| C0082 | w | 376 | 341956 | 342106 | 150 | yahJ | yahK | 1;2;3;8;9;10;11;12 | 1309 | 0.13 | 100 | |||
| C0088 | w | 182 | 405549 | 405621 | 72 | yaiI | aroL | 1;2;3;4;5;6;7;8;10;11;12;13 | 3922 | 0.058 | 100 | ORF 81 | ||
| C0091 | w | 406 | 418636 | 418813 | 177 | phoR | brnQ | 2;4;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2241 | Yes | 5.00E-17 | 91 | ||
| C0093 | c | 298 | 431275 | 431351 | 76 | tsx | yajI | 2;13 | 1450 | Yes | 1.00E-18 | 92 | ||
| C0096 | w | 205 | 440711 | 440771 | 60 | xseB | yajK | 2;3;4;7;8;10;11;12 | 1411 | 0.19 | 91 | ORF 90 | ||
| C0097 | w | 149 | 443795 | 443886 | 91 | apbA | yajQ | 1;2;3;4;5;8;9;10;11 | 993 | 1.2 | 100 | |||
| C0100 | w | 169 | 453568 | 453640 | 72 | yajG | bolA | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 2369 | Yes | 4.00E-09 | 90 | ||
| C0103 | w | 245 | 455784 | 455899 | 115 | tig | clpP | 2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 4710 | Yes | 4.00E-38 | 92 | ||
| C0105 | w | 187 | 457928 | 458098 | 170 | clpX | lon | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2103 | 5UTR | Yes | 5.00E-29 | 90 | |
| C0106 | w | 208 | 460538 | 460648 | 110 | lon | hupB | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2893 | Yes | 2.00E-18 | 89 | ORF 84 | |
| C0107 | c | 545 | 479932 | 480047 | 115 | ybaJ | acrB | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 2816 | 0.1 | 95 | |||
| C0108 | c | 141 | 484843 | 484953 | 110 | acrA | acrR | 1;2;3;5;7;8;10;11;12 | 3142 | Yes | 4.00E-44 | 95 | ||
| C0109 | w | 141 | 484845 | 484938 | 93 | acrA | acrR | 2 | 511 | Yes | 8.00E-39 | 96 | ||
| C0113 | w | 152 | 490523 | 490634 | 111 | ybaN | apt | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4587 | Yes | 1.00E-10 | 100 | ||
| C0121 | w | 261 | 510791 | 510857 | 66 | ybaR | ybaS | 3;7;8;9;10;12 | 2419 | 5UTR | 0.2 | 100 | ||
| C0123 | w | 124 | 513096 | 513215 | 119 | ybaT | ybbI | 2;6;8;9;10;11;12 | 2193 | 5UTR | 0.1 | 100 | ||
| C0126 | c | 173 | 553661 | 553754 | 93 | ppiB | cysS | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5358 | 0.078 | 100 | |||
| C0127 | w | 173 | 553760 | 553832 | 72 | ppiB | cysS | 2;7;8;12;13 | 582 | Yes | 2.00E-05 | 93 | ||
| C0131 | c | 93 | 604649 | 604725 | 76 | nfnB | ybdF | 2;3;7;8;12;13 | 616 | 0.062 | 100 | |||
| C0134 | c | 320 | 611721 | 611858 | 137 | fepA | fes | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 12789 | 5UTR | 0.48 | 100 | ORF 96 | |
| C0135 | w | 320 | 611931 | 612024 | 93 | fepA | fes | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11 | 3389 | 0.31 | 100 | |||
| C0138 | c | 374 | 623749 | 623945 | 196 | fepB | entC | 2;7 | 2095 | 0.18 | 95 | |||
| C0139 | w | 374 | 624034 | 624106 | 72 | fepB | entC | 1;2;3;7;8;9;10;11 | 1512 | 0.015 | 92 | |||
| C0143 | w | 311 | 637863 | 638166 | 303 | dsbG | ahpC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 11123 | Yes | 6.00E-24 | 91 | ||
| C0147 | w | 174 | 656425 | 656510 | 85 | crcA | cspE | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 8340 | 5UTR | Yes | 2.00E-23 | 97 | |
| C0148 | w | 128 | 658045 | 658165 | 120 | ybeM | ybeC | 2;4;5;7;8;10;11;12 | 1953 | 5UTR | Yes | 6.00E-28 | 97 | |
| C0150 | c | 166 | 661435 | 661532 | 97 | lipB | ybeD | 2;7;8;11;12;13 | 978 | Yes | 4.00E-25 | 96 | ORF 75 | |
| C0154 | c | 367 | 668151 | 668285 | 134 | ybeB | phpB | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3429 | Yes | 1.00E-57 | 97 | ||
| C0155 | c | 234 | 674006 | 674202 | 196 | leuS | ybeL | 1;2;3;4;7;8;10;11;12;13 | 1710 | 5UTR | Yes | 1.00E-20 | 92 | |
| C0156 | w | 234 | 674163 | 674237 | 74 | leuS | ybeL | 8 | 917 | Yes | 3.00E-07 | 94 | ||
| C0159 | c | 249 | 686974 | 687079 | 105 | ybeJ | lnt | 2;3;11;12 | 5041 | 0.09 | 95 | |||
| C0163 | w | 332 | 703078 | 703153 | 75 | nagB | nagE | 2;13 | 1820 | 0.061 | 100 | |||
| C0165 | c | 288 | 709869 | 710073 | 204 | fur | fldA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9677 | Yes | 1.00E-27 | 89 | ||
| C0167 | c | 139 | 710694 | 710798 | 104 | fldA | ybfE | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2323 | Yes | 3.00E-29 | 91 | ||
| C0169 | w | 184 | 712108 | 712208 | 100 | ybfF | seqA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2407 | Yes | 6.00E-12 | 83 | ||
| C0170 | c | 401 | 727967 | 728050 | 83 | kdpA | ybfA | 12 | 723 | Yes | 8.00E-14 | 86 | ||
| C0172 | c | 708 | 753691 | 753985 | 294 | gltA | sdhC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 11513 | 5UTR | Yes | 4.00E-25 | 83 | |
| C0173 | w | 708 | 754177 | 754398 | 221 | gltA | sdhC | 2;4;6;7;8;11;12;13 | 7232 | 5UTR | Yes | 1.00E-64 | 95 | |
| C0176 | w | 843 | 770194 | 770676 | 482 | ybgG | cydA | 2;5;8;9;10;11;12;13 | 17443 | Yes | 1.00E-35 | 98 | ||
| C0184 | c | 315 | 784540 | 784665 | 125 | b0753 | aroG | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 3513 | Yes | 1.00E-16 | 96 | ORF 108 | |
| C0190 | w | 578 | 812665 | 812747 | 82 | bioD | uvrB | 2;4;7;8;11 | 796 | Yes | 2.00E-05 | 90 | ||
| C0191 | w | 396 | 816141 | 816265 | 124 | ybhK | moaA | 2;10;11;12 | 1271 | Yes | 4.00E-32 | 90 | ||
| C0199 | w | 352 | 849350 | 849671 | 321 | ybiF | ompX | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 13935 | Yes | 7.00E-36 | 91 | Reg Lrp | |
| C0202 | w | 242 | 852327 | 852404 | 77 | b0816 | b0817 | 8 | 1150 | Yes | 0.001 | 96 | ||
| C0203 | w | 212 | 877433 | 877464 | 31 | yliG | b0836 | 1;2;4;5;9;10;11 | 27406 | 5UTR | 1.1 | 100 | ||
| C0205 | c | 284 | 882611 | 882732 | 121 | ybjG | cmr | 2;3;5;7;8;11 | 1810 | 1.6 | 100 | ORF 84 | ||
| C0206 | w | 269 | 889113 | 889310 | 197 | b0847 | ybjM | 2;3;8;10;11 | 1993 | 0.18 | 100 | |||
| C0207 | w | 350 | 892869 | 892979 | 110 | ybjN | potF | 3 | 2942 | 5UTR | 0.095 | 100 | ||
| C0211 | c | 425 | 915294 | 915387 | 93 | aqpZ | ybjD | 2;4;10 | 567 | 0.31 | 100 | |||
| C0212 | c | 322 | 921815 | 921899 | 84 | cspD | yljA | 4 | 21625 | 5UTR | Yes | 6.00E-24 | 91 | |
| C0213 | w | 322 | 921824 | 922133 | 309 | cspD | yljA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 5647 | 5UTR | Yes | 3.00E-44 | 85 | Reg PapB |
| C0216 | c | 253 | 925197 | 925347 | 150 | serW | infA | 1;2;3;4;5;8;10;11 | 1484 | Yes | 4.00E-14 | 91 | ||
| C0217 | c | 284 | 925666 | 925905 | 239 | infA | aat | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4516 | 5UTR | Yes | 2.00E-26 | 94 | |
| C0220 | w | 544 | 931504 | 931794 | 290 | trxB | lrp | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 6512 | Yes | 1.00E-65 | 92 | ||
| C0221 | w | 134 | 932349 | 932445 | 96 | lrp | ftsK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1927 | Yes | 2.00E-33 | 93 | ||
| C0222 | w | 155 | 936436 | 936585 | 149 | ftsK | lolA | 1;2;3;4;5;7;8;9;11 | 2683 | 5UTR | Yes | 3.00E-15 | 94 | |
| C0225 | w | 198 | 956722 | 956870 | 148 | ycaP | serC | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5937 | Yes | 2.00E-09 | 88 | ||
| C0227 | w | 172 | 960298 | 960422 | 124 | ycaL | cmk | 1;2;3;4;7;8;9;10;11;13 | 3271 | Yes | 2.00E-24 | 87 | ||
| C0235 | w | 180 | 982123 | 982296 | 173 | ycbB | ycbK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4696 | 5UTR | Yes | 1.00E-08 | 87 | ORF 75 |
| C0239 | c | 602 | 986226 | 986355 | 129 | ompF | asnS | 1;2;3;5;8;9;10;11;13 | 17603 | Yes | 3.00E-51 | 95 | ||
| C0242 | c | 265 | 989580 | 989707 | 127 | pncB | pepN | 1;2;3;5;6;7;8;10;11;12;13 | 3170 | 5UTR | Yes | 4.00E-23 | 87 | |
| C0244 | w | 243 | 1006899 | 1006960 | 61 | b0947 | ycbY | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1580 | Yes | 3.00E-09 | 97 | ||
| C0249 | c | 356 | 1019279 | 1019464 | 185 | ompA | sulA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 25319 | 5UTR | Yes | 1.00E-88 | 97 | |
| C0251 | c | 181 | 1029117 | 1029215 | 98 | b0967 | b0968 | 7;8;11 | 1037 | Yes | 2.00E-08 | 88 | ||
| C0253 | c | 426 | 1030941 | 1031319 | 378 | serT | hyaA | 2;4 | 1160 | 5UTR | Yes | 2.00E-09 | 86 | |
| C0254 | w | 426 | 1031202 | 1031350 | 148 | serT | hyaA | 12 | 1983 | 2.1 | 100 | |||
| C0255 | w | 133 | 1036882 | 1036961 | 79 | hyaF | appC | 12 | 471 | 1 | 100 | |||
| C0257 | c | 432 | 1049755 | 1049903 | 148 | ymcD | cspH | 2;8 | 6293 | 2.1 | 94 | |||
| C0259 | w | 285 | 1050539 | 1050676 | 137 | cspH | cspG | 2;4;5;6;8;11;12;13 | 4373 | 5UTR | 1.9 | 100 | ORF 111 | |
| C0262 | c | 209 | 1066931 | 1067071 | 140 | wrbA | ycdF | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 4061 | Yes | 0.0005 | 82 | ||
| C0268 | w | 194 | 1096971 | 1097067 | 96 | ycdU | ycdW | 2;3;11 | 832 | Yes | 5.00E-06 | 90 | ||
| C0271 | c | 754 | 1102759 | 1102926 | 167 | csgD | csgB | 3;4 | 546 | 2.3 | 100 | Leader CsgD | ||
| C0273 | c | 286 | 1120178 | 1120251 | 73 | yceP | dinI | 1;2;3;4;5;8;10;11;12;13 | 13696 | 5UTR | Yes | 0.001 | 84 | ORF 135 |
| C0274 | c | 105 | 1121846 | 1121888 | 42 | pyrC | yceB | 2;3;6;7;8;9;11;12;13 | 9827 | 5UTR | Yes | 3.00E-08 | 97 | |
| C0275 | c | 133 | 1122496 | 1122602 | 106 | yceB | grxB | 2;7;8;12 | 1856 | 0.091 | 100 | |||
| C0278 | c | 159 | 1145863 | 1146008 | 145 | yceF | yceD | 2;3;4;7;8;10 | 1644 | Yes | 2.00E-37 | 94 | ||
| sraB | w | 159 | 1145865 | 1146006 | 141 | yceF | yceD | 1;2;3;4;5;7;8;9;11;12;13 | 9699 | Yes | 3.00E-36 | 94 | sraB (sRNA) | |
| C0285 | w | 294 | 1156807 | 1157090 | 283 | ycfH | ptsG | 1;2;3;5;8;11;12;13 | 2889 | 5UTR | Yes | 3.00E-22 | 84 | |
| C0291 | w | 201 | 1194185 | 1194344 | 159 | ymfC | icdA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 18478 | 5UTR | Yes | 2.00E-34 | 87 | ORF 81 |
| C0295 | w | 519 | 1225736 | 1225819 | 83 | minC | ycgJ | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11 | 1387 | 5UTR | 0.27 | 100 | ||
| C0296 | c | 208 | 1226695 | 1226791 | 96 | ycgK | ycgL | 1;2;3;5 | 10537 | Yes | 0.005 | 100 | ||
| C0297 | w | 208 | 1226762 | 1226902 | 140 | ycgK | ycgL | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 2507 | 5UTR | 0.12 | 100 | ||
| C0301 | c | 329 | 1236464 | 1236536 | 72 | ycgB | dadA | 1;2;3;4;5;8;9;10;11 | 4352 | 5UTR | Yes | 4.00E-15 | 91 | |
| C0308 | c | 213 | 1262723 | 1262800 | 77 | hemM | hemA | 2;3;12 | 1567 | 5UTR | 0.063 | 92 | ||
| C0316 | w | 91 | 1289387 | 1289459 | 72 | ychK | hnr | 2;3;4;5;8;10;11;12 | 4812 | Yes | 7.00E-20 | 91 | ||
| C0320 | c | 476 | 1297371 | 1297634 | 263 | adhE | ychE | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 6060 | Yes | 1.00E-21 | 87 | ||
| C0321 | w | 737 | 1298651 | 1299159 | 508 | ychE | oppA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 15882 | 5UTR | Yes | 5.00E-07 | 85 | |
| C0323 | c | 356 | 1311687 | 1311772 | 85 | yciC | yciD | 2;3;8 | 2532 | Yes | 1.00E-15 | 88 | ||
| C0326 | w | 210 | 1324706 | 1324874 | 168 | yciQ | yciL | 2;3;10;11;13 | 1688 | Yes | 0.0002 | 91 | ||
| C0327 | c | 219 | 1327136 | 1327246 | 110 | yciK | sohB | 3;5;8;10;11 | 684 | 0.095 | 100 | ORF 75 | ||
| C0328 | w | 379 | 1328835 | 1329061 | 226 | yciN | topA | 2;3;4;7;8;11;12;13 | 2422 | Yes | 2.00E-32 | 92 | ORF 156 | |
| C0329 | w | 1001 | 1333436 | 1333711 | 275 | cysB | acnA | 3 | 1728 | 0.26 | 100 | Reg NAC | ||
| C0332 | c | 268 | 1341404 | 1341487 | 83 | osmB | b1284 | 3;4 | 2244 | Yes | 1.00E-06 | 92 | ||
| C0333 | c | 410 | 1342405 | 1342631 | 226 | b1284 | yciR | 2;11 | 2486 | Yes | 1.00E-05 | 85 | ||
| C0335 | c | 367 | 1349063 | 1349305 | 242 | fabI | ycjD | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4260 | 5UTR | 0.22 | 100 | ||
| C0341 | c | 274 | 1388684 | 1388801 | 117 | ycjI | b1327 | 1;2;3;4;7;8;9;11;12 | 707 | 0.4 | 100 | ORF 93 | ||
| C0342 | c | 153 | 1393946 | 1394022 | 76 | b1330 | ynaJ | 2;3;4;7;8;10;11 | 850 | 0.96 | 100 | |||
| C0348 | c | 207 | 1440867 | 1440897 | 30 | ldhA | ydbH | 2;3;8;10;12 | 560 | 0.018 | 96 | |||
| C0349 | c | 500 | 1488389 | 1488803 | 414 | gapC | cybB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 12381 | Yes | 3.00E-05 | 91 | ||
| C0353 | w | 224 | 1494782 | 1494866 | 84 | b1423 | ydcG | 2;10 | 1559 | Yes | 5.00E-18 | 89 | ||
| C0355 | w | 244 | 1509565 | 1509676 | 111 | b1439 | b1440 | 4;5 | 13061 | 1.5 | 100 | ORF 90 | ||
| C0356 | w | 85 | 1515589 | 1515670 | 81 | b1445 | b1446 | 2;7;8;10;12;13 | 1378 | 5UTR | 0.26 | 100 | ||
| C0357 | w | 241 | 1521250 | 1521329 | 79 | b1451 | b1452 | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11 | 15095 | 5UTR | 0.25 | 100 | ||
| C0364 | c | 129 | 1553735 | 1553837 | 102 | sfcA | rpsV | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1821 | Yes | 1.00E-06 | 92 | ||
| C0367 | c | 363 | 1565176 | 1565322 | 146 | b1490 | b1491 | 2;3;4;8;10;11 | 6986 | 5UTR | 0.51 | 100 | ||
| C0373 | c | 293 | 1619062 | 1619176 | 114 | ydeD | ydeF | 1;2;3;4;5;8;11 | 952 | Yes | 2.00E-12 | 86 | ORF 111 | |
| C0374 | w | 88 | 1626300 | 1626374 | 74 | ydfG | ydfH | 2;3;4;6;7;11;12;13 | 1607 | 5UTR | 0.93 | 100 | ||
| C0375 | c | 753 | 1630539 | 1630564 | 25 | b1543 | b1547 | 4 | 5074 | 5UTR | 0.78 | 100 | ||
| er32 | c | 362 | 1636715 | 1636818 | 103 | cspI | ydfP | 4;5;8;10;11 | 1032 | 5UTR | 0.088 | 100 | ORF 84 | |
| C0380 | c | 300 | 1639581 | 1639743 | 162 | cspB | cspF | 2;3;4;5;6;7;8;11 | 1151 | 0.57 | 95 | ORF 90 | ||
| C0388 | w | 340 | 1647307 | 1647404 | 97 | ydfC | dicF | 4 | 1568 | 1.3 | 100 | |||
| C0390 | w | 134 | 1653736 | 1653824 | 88 | b1582 | b1583 | 2 | 2228 | 5UTR | 0.29 | 100 | ||
| C0395 | c | 523 | 1675928 | 1676264 | 336 | pntA | b1604 | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 4183 | Yes | 2.00E-11 | 89 | ||
| C0396 | c | 198 | 1686401 | 1686546 | 145 | fumA | manA | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 2265 | 5UTR | Yes | 1.00E-29 | 88 | ORF 84 |
| C0399 | c | 111 | 1696064 | 1696146 | 82 | hdhA | malI | 2;3;4;5;8;10;12 | 3155 | 0.017 | 95 | |||
| C0400 | c | 174 | 1697206 | 1697290 | 84 | malI | malX | 2 | 1165 | 5UTR | 0.27 | 100 | ||
| C0403 | w | 273 | 1717795 | 1717897 | 102 | b1640 | slyB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 16076 | 5UTR | 1.4 | 100 | ||
| C0404 | c | 333 | 1732133 | 1732283 | 150 | ydhD | ydhO | 2;3;4;8 | 4463 | Yes | 6.00E-07 | 89 | ||
| C0407 | w | 553 | 1735693 | 1735866 | 173 | b1657 | purR | 1;2;7;8;11;12;13 | 3082 | 5UTR | Yes | 8.00E-25 | 84 | |
| C0408 | w | 290 | 1739219 | 1739435 | 216 | ydhC | cfa | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12 | 6835 | 5UTR | Yes | 2.00E-38 | 85 | |
| C0409 | c | 214 | 1741266 | 1741439 | 173 | ribE | ydhE | 2;3;8 | 1117 | 5UTR | Yes | 1.00E-11 | 88 | |
| C0410 | w | 556 | 1753493 | 1753720 | 227 | b1675 | pykF | 2;3;4;7;8;10;11;12;13 | 2069 | Yes | 5.00E-33 | 83 | ||
| C0413 | c | 388 | 1766709 | 1766926 | 217 | ydiJ | b1688 | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12 | 2057 | Yes | 4.00E-27 | 89 | ||
| C0414 | w | 388 | 1766957 | 1767060 | 103 | ydiJ | b1688 | 2;8;10;12 | 1163 | Yes | 1.00E-19 | 94 | ||
| C0423 | c | 523 | 1800594 | 1800815 | 221 | thrS | b1720 | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9566 | Yes | 1.00E-18 | 86 | ||
| C0429 | w | 341 | 1860559 | 1860793 | 234 | yeaA | gapA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13333 | Yes | 6.00E-79 | 94 | ||
| C0432 | w | 435 | 1864770 | 1864916 | 146 | yeaF | yeaG | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 7254 | 5UTR | Yes | 7.00E-31 | 87 | |
| C0434 | c | 147 | 1877285 | 1877404 | 119 | yeaQ | yoaG | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 10135 | 5UTR | 0.41 | 100 | ||
| C0435 | w | 361 | 1892011 | 1892095 | 84 | b1809 | b1810 | 2;3;4;5;8;10;11;12 | 3383 | 0.27 | 100 | |||
| C0436 | w | 183 | 1894786 | 1894942 | 156 | yeaB | sdaA | 2;4;12;13 | 2557 | Yes | 2.00E-22 | 88 | ||
| C0437 | w | 462 | 1899815 | 1900057 | 242 | yoaE | manX | 2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 | 5239 | Yes | 2.00E-48 | 86 | Reg NagC | |
| C0440 | c | 669 | 1905630 | 1905817 | 187 | b1824 | b1825 | 4;12 | 3470 | Yes | 9.00E-28 | 93 | ||
| C0452 | w | 337 | 1934492 | 1934674 | 182 | zwf | yebK | 2;3;4;5;8;11;12;13 | 1061 | 0.65 | 95 | |||
| C0453 | c | 337 | 1934571 | 1934667 | 96 | zwf | yebK | 2;3;8;11;12 | 731 | 5UTR | 0.32 | 95 | ||
| C0468 | w | 537 | 1977694 | 1977770 | 76 | flhD | yecG | 3 | 656 | 3.8 | 100 | |||
| C0471 | c | 150 | 1990141 | 1990286 | 145 | glyW | pgsA | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 10540 | 5UTR | Yes | 8.00E-40 | 92 | |
| C0474 | w | 198 | 2023365 | 2023528 | 163 | dsrA | b1955 | 2;3;4;5;8;10;11;12 | 5952 | 5UTR | 0.15 | 100 | ||
| C0483 | w | 100 | 2042490 | 2042565 | 75 | b1976 | asnT | 2;3;5;12 | 1610 | Yes | 0.001 | 100 | ||
| C0489 | c | 105 | 2077449 | 2077544 | 95 | yeeX | yeeA | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 6088 | Yes | 1.00E-06 | 92 | ||
| C0492 | w | 145 | 2088076 | 2088202 | 126 | hisL | hisG | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12 | 6034 | 3UTR | Yes | 2.00E-43 | 99 | |
| C0494 | c | 372 | 2111107 | 2111376 | 269 | rfbB | galF | 2;3;4;7;9 | 3835 | Yes | 4.00E-06 | 90 | Reg PdhR | |
| C0499 | w | 146 | 2163587 | 2163682 | 95 | b2080 | yegQ | 2;3;7;12 | 898 | Yes | 2.00E-24 | 90 | ||
| C0504 | c | 222 | 2183321 | 2183466 | 145 | thiM | yohL | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11 | 5855 | 5UTR | Yes | 1.00E-32 | 96 | ORF 99 |
| C0507 | c | 210 | 2217518 | 2217599 | 81 | yehZ | bglX | 2;3;4;12 | 986 | 0.066 | 100 | |||
| C0515 | c | 279 | 2238380 | 2238572 | 192 | mglB | galS | 12;13 | 4979 | 5UTR | Yes | 0.0007 | 100 | |
| C0517 | c | 257 | 2241672 | 2241815 | 143 | folE | yeiG | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 20909 | 5UTR | Yes | 6.00E-16 | 89 | ORF 81 |
| C0518 | w | 257 | 2241680 | 2241766 | 86 | folE | yeiG | 3;4 | 23664 | Yes | 3.00E-07 | 92 | ORF 81 | |
| C0519 | c | 293 | 2244789 | 2244964 | 175 | cirA | lysP | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11 | 18166 | Yes | 1.00E-08 | 90 | ||
| C0521 | c | 367 | 2261515 | 2261611 | 96 | fruB | yeiO | 3 | 5962 | Yes | 6.00E-12 | 95 | ORF 141 | |
| C0522 | w | 411 | 2267821 | 2267985 | 164 | b2174 | spr | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 7805 | 5UTR | Yes | 4.00E-08 | 97 | |
| C0523 | c | 332 | 2276258 | 2276449 | 191 | yejG | bcr | 8 | 2910 | Yes | 2.00E-10 | 100 | ||
| C0524 | w | 124 | 2280451 | 2280522 | 71 | yejH | rplY | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 10368 | 5UTR | Yes | 5.00E-27 | 97 | |
| C0527 | c | 738 | 2310803 | 2310875 | 72 | ompC | yojN | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 20457 | Yes | 5.00E-24 | 93 | ||
| C0529 | w | 695 | 2342810 | 2342882 | 72 | yfaL | nrdA | 2;12 | 703 | 5UTR | 0.9 | 100 | ||
| C0531 | c | 272 | 2350406 | 2350478 | 72 | glpT | glpA | 3;5;13 | 2590 | 0.058 | 100 | ORF 85 | ||
| C0542 | c | 630 | 2403092 | 2403537 | 445 | nuoA | lrhA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5101 | 5UTR | Yes | 6.00E-62 | 88 | |
| C0544 | c | 919 | 2404661 | 2405039 | 378 | lrhA | b2290 | 2;3;4;5;8;11 | 2369 | 5UTR | Yes | 7.00E-15 | 87 | |
| C0545 | c | 337 | 2411153 | 2411480 | 327 | b2295 | ackA | 2;3;4 | 9202 | Yes | 3.00E-29 | 90 | ||
| C0546 | w | 337 | 2411335 | 2411488 | 153 | b2295 | ackA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3847 | Yes | 7.00E-16 | 92 | ||
| C0550 | c | 89 | 2423936 | 2424024 | 88 | hisQ | hisJ | 1;2;3;5;6;7;8;9;11;12;13 | 2871 | 5UTR | Yes | 0.0003 | 96 | |
| C0551 | c | 220 | 2424945 | 2425022 | 77 | hisJ | argT | 2;3;8;11 | 1932 | 0.016 | 100 | Reg NR_I | ||
| C0552 | c | 265 | 2425811 | 2425920 | 109 | argT | ubiX | 2;3;4;5;9;11;12;13 | 1417 | 5UTR | Yes | 7.00E-12 | 95 | ORF 189 |
| C0563 | c | 341 | 2458978 | 2459145 | 167 | b2343 | fadL | 4 | 1367 | 5UTR | Yes | 7.00E-19 | 84 | |
| C0564 | c | 293 | 2463042 | 2463174 | 132 | vacJ | yfdC | 2;3;4;5;7;8;10;11;12;13 | 1552 | Yes | 2.00E-25 | 96 | ||
| C0565 | w | 273 | 2471359 | 2471388 | 29 | yfdO | b2359 | 3;4;7 | 570 | 0.26 | 100 | Reg RhaS | ||
| C0567 | w | 415 | 2481662 | 2481773 | 111 | emrK | evgA | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 4637 | Yes | 0.0004 | 100 | ||
| C0568 | w | 286 | 2493513 | 2493597 | 84 | b2377 | ddg | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4935 | 5UTR | Yes | 2.00E-11 | 95 | |
| C0569 | c | 203 | 2507446 | 2507592 | 146 | glk | b2389 | 2 | 1463 | Yes | 1.00E-29 | 86 | ||
| C0572 | c | 335 | 2510727 | 2510856 | 129 | b2392 | nupC | 2;4;7;8;10;12 | 2841 | 5UTR | Yes | 5.00E-13 | 97 | |
| C0574 | c | 258 | 2518693 | 2518795 | 102 | gltX | xapR | 2;7;8;10;11;12;13 | 3449 | Yes | 1.00E-19 | 98 | close to tRNA | |
| C0577 | c | 229 | 2529263 | 2529421 | 158 | zipA | cysZ | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12 | 2994 | Yes | 2.00E-47 | 90 | ||
| C0578 | w | 383 | 2531451 | 2531774 | 323 | cysK | ptsH | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 8770 | 5UTR | Yes | 2.00E-76 | 94 | ORF 126 |
| C0582 | c | 104 | 2535262 | 2535341 | 79 | pdxK | yfeK | 2;5;8;9;11;12;13 | 856 | 5UTR | 0.065 | 100 | ||
| C0601 | c | 212 | 2595638 | 2595820 | 182 | purC | nlpB | 2;6;7;8;11;12 | 2647 | 5UTR | Yes | 1.00E-08 | 90 | |
| C0602 | w | 212 | 2614005 | 2614112 | 107 | perM | b2494 | 2;8;12 | 1019 | Yes | 0.006 | 100 | ||
| C0609 | c | 110 | 2638619 | 2638703 | 84 | hisS | gcpE | 5;8;11;12 | 3003 | 5UTR | Yes | 1.00E-21 | 89 | |
| C0610 | c | 284 | 2640864 | 2641118 | 254 | yfgA | yfgB | 2;3;4;7;8;9;10;11;12;13 | 2409 | Yes | 2.00E-17 | 92 | ORF 87 | |
| C0612 | c | 149 | 2642303 | 2642440 | 137 | yfgB | ndk | 2;7;8;11;12;13 | 2293 | 5UTR | Yes | 6.00E-56 | 95 | |
| C0613 | c | 148 | 2642888 | 2642960 | 72 | ndk | pbpC | 2;5;6;7;8;9;11;12;13 | 3799 | 5UTR | 0.058 | 95 | ||
| C0620 | c | 135 | 2666936 | 2667012 | 76 | hcaR | hcaA1 | 5 | 916 | 0.062 | 100 | |||
| C0622 | c | 494 | 2689188 | 2689357 | 169 | yfhK | purL | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11 | 17719 | 5UTR | Yes | 1.00E-66 | 94 | ORF 147 |
| C0625 | c | 199 | 2696507 | 2696601 | 94 | yfhB | yfhH | 1;2;3;4;5;7;8;12 | 1459 | 5UTR | Yes | 2.00E-11 | 85 | |
| C0627 | c | 271 | 2702094 | 2702217 | 123 | rnc | lepB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5179 | Yes | 1.00E-13 | 95 | ORF 135 | |
| C0630 | c | 407 | 2708047 | 2708180 | 133 | rpoE | nadB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 12414 | 5UTR | Yes | 7.00E-37 | 89 | |
| C0633 | c | 322 | 2723766 | 2723879 | 113 | kgtP | rrfG | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 23791 | 1.5 | 100 | |||
| C0636 | c | 129 | 2732196 | 2732308 | 112 | clpB | yfiH | 1;2;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 15145 | 5UTR | Yes | 2.00E-33 | 90 | |
| C0637 | w | 134 | 2734035 | 2734157 | 122 | sfhB | b2595 | 2;3;8;12 | 6534 | Yes | 3.00E-51 | 97 | ||
| C0644 | w | 122 | 2748777 | 2748850 | 73 | grpE | yfjB | 2;6;7;8;11;12 | 1452 | Yes | 5.00E-27 | 95 | ||
| C0653 | w | 247 | 2798658 | 2798738 | 80 | ygaM | nrdH | 2;3;4;5;8;11 | 6094 | 5UTR | Yes | 3.00E-10 | 87 | |
| C0659 | c | 234 | 2817168 | 2817392 | 224 | csrA | alaS | 2;3;4;5;7;8;10;11;12 | 18701 | 5UTR | Yes | 1.00E-89 | 97 | |
| C0661 | c | 128 | 2820033 | 2820118 | 85 | alaS | oraA | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 2644 | Yes | 2.00E-05 | 100 | ||
| C0670 | c | 193 | 2870845 | 2871026 | 181 | b2748 | ygbE | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1727 | 5UTR | Yes | 1.00E-17 | 87 | |
| C0681 | w | 111 | 2924244 | 2924327 | 83 | yqcD | ygdH | 8;12 | 1280 | Yes | 2.00E-17 | 91 | ||
| C0682 | w | 556 | 2926149 | 2926246 | 97 | ygdH | sdaC | 12;13 | 1100 | 5UTR | 0.32 | 100 | ||
| C0688 | c | 128 | 2978663 | 2978742 | 79 | ygeA | araE | 8 | 1386 | 1 | 100 | |||
| C0689 | c | 113 | 2996923 | 2997000 | 77 | b2863 | glyU | 2 | 1892 | 0.063 | 95 | |||
| C0690 | c | 429 | 2998087 | 2998261 | 174 | b2865 | b2866 | 2;8 | 1627 | 2.4 | 100 | |||
| C0691 | c | 166 | 3034236 | 3034359 | 123 | prfB | recJ | 8;11;12 | 3231 | 5UTR | Yes | 6.00E-34 | 91 | |
| C0693 | c | 111 | 3037763 | 3037867 | 104 | xerD | fldB | 2;8;10;11;12 | 1152 | 5UTR | Yes | 6.00E-09 | 88 | |
| C0698 | c | 447 | 3048687 | 3048816 | 129 | gcvT | visC | 2;3;5;6;8;10;11;12;13 | 4044 | 5UTR | Yes | 0.0001 | 89 | |
| C0699 | w | 161 | 3053509 | 3053630 | 121 | ygfB | ygfE | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2257 | Yes | 2.00E-43 | 93 | ||
| C0700 | c | 161 | 3053546 | 3053619 | 73 | ygfB | ygfE | 3 | 10683 | Yes | 2.00E-23 | 94 | ||
| C0705 | c | 284 | 3071711 | 3071847 | 136 | epd | yggC | 2 | 5689 | Yes | 3.00E-27 | 90 | ||
| C0706 | c | 151 | 3079654 | 3079739 | 85 | tktA | yggG | 2;3;5;6;7;8;9;11;12;13 | 5002 | 5UTR | Yes | 6.00E-30 | 94 | |
| C0710 | c | 120 | 3084089 | 3084194 | 105 | yqgB | yqgC | 2;3;7;8;11;12;13 | 2500 | 5UTR | Yes | 2.00E-18 | 93 | |
| C0714 | c | 160 | 3100870 | 3101029 | 159 | yggH | mutY | 2;8;12 | 3802 | Yes | 8.00E-31 | 90 | ||
| C0715 | w | 160 | 3100935 | 3101009 | 74 | yggH | mutY | 1;2;3;4;7;8;11;12;13 | 668 | Yes | 2.00E-17 | 94 | ||
| C0717 | c | 336 | 3107257 | 3107345 | 88 | speC | yqgA | 2;3;7;8;10;11;12 | 1954 | Yes | 6.00E-21 | 92 | ORF 111 | |
| C0721 | c | 156 | 3136543 | 3136652 | 109 | gsp | b2989 | 2;3;8;11;12 | 3987 | 5UTR | Yes | 4.00E-07 | 89 | |
| C0726 | w | 198 | 3175934 | 3176123 | 189 | yqiE | tolC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1625 | Yes | 5.00E-20 | 89 | ||
| C0727 | w | 115 | 3180459 | 3180555 | 96 | ygiD | ygiE | 2;3;4;8;11 | 1184 | Yes | 9.00E-08 | 90 | ||
| C0728 | c | 313 | 3182499 | 3182673 | 174 | ribB | b3042 | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 3913 | 5UTR | Yes | 3.00E-46 | 91 | ORF 144 / Reg PutA |
| C0729 | c | 268 | 3189957 | 3190029 | 72 | glgS | b3050 | 2;3;4;8;10;12 | 4777 | 5UTR | Yes | 1.00E-09 | 97 | |
| C0732 | w | 241 | 3198704 | 3198846 | 142 | ygiF | ygiM | 2;3;4;5;7;8;11;12;13 | 1544 | 5UTR | Yes | 3.00E-39 | 90 | ORF 75 |
| C0734 | w | 237 | 3208328 | 3208415 | 87 | ygjD | rpsU | 2;3;4;7;8;11 | 5462 | 5UTR | Yes | 8.00E-45 | 100 | |
| C0741 | w | 396 | 3237503 | 3237580 | 77 | ygjT | ygjU | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 4168 | Yes | 7.00E-11 | 100 | ||
| C0742 | w | 344 | 3245105 | 3245411 | 306 | exuR | yqjA | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12 | 6794 | 5UTR | Yes | 7.00E-33 | 85 | |
| C0743 | w | 131 | 3246508 | 3246592 | 84 | yqjB | yqjC | 2;3;4;8;12 | 2646 | 5UTR | 1.1 | 88 | ||
| C0754 | c | 148 | 3309326 | 3309466 | 140 | rpsO | truB | 1;2;3;4;5;7;8;11;12 | 10866 | 5UTR | Yes | 5.00E-41 | 90 | |
| C0758 | c | 347 | 3315939 | 3316043 | 104 | metY | argG | 2;12 | 1358 | Yes | 5.00E-22 | 93 | ||
| C0759 | w | 347 | 3316167 | 3316271 | 104 | metY | argG | 2;3;7;8;11;12 | 5056 | Yes | 3.00E-20 | 96 | Reg ArgR | |
| C0760 | c | 227 | 3320146 | 3320281 | 135 | secG | mrsA | 2;3;5;7;8;10;11;12;13 | 4329 | 5UTR | Yes | 4.00E-57 | 97 | |
| C0763 | c | 125 | 3325311 | 3325421 | 110 | ftsJ | yhbY | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 | 9103 | Yes | 6.00E-34 | 94 | ||
| C0764 | w | 125 | 3325321 | 3325426 | 105 | ftsJ | yhbY | 1;2;3;4;5;8;10;11;12;13 | 3226 | Yes | 2.00E-36 | 94 | ||
| C0766 | c | 262 | 3326362 | 3326539 | 177 | greA | dacB | 2;12 | 2774 | Yes | 7.00E-10 | 86 | ||
| C0745 | c | 258 | 3331101 | 3331194 | 93 | rplU | ispB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 22385 | Yes | 5.00E-34 | 95 | ORF 87 | |
| C0770 | c | 209 | 3337706 | 3337890 | 184 | yrbF | yrbG | 2;3;8;12;13 | 1431 | Yes | 3.00E-24 | 89 | Reg DeoR | |
| C0772 | w | 117 | 3344109 | 3344217 | 108 | yhbH | ptsN | 2;5;6;7;8;9;10;11;12 | 5746 | 5UTR | Yes | 4.00E-07 | 88 | |
| C0775 | w | 581 | 3352147 | 3352243 | 96 | yhcC | gltB | 1;2;5;6;7;8;9;10;11;12 | 18841 | 5UTR | Yes | 5.00E-31 | 92 | |
| C0777 | c | 394 | 3375055 | 3375186 | 131 | sspA | rpsI | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2117 | 5UTR | Yes | 9.00E-18 | 89 | Reg GalR |
| C0778 | c | 218 | 3376296 | 3376458 | 162 | rplM | yhcM | 1;2;3;5;6;7;8;10;11;12;13 | 21238 | 5UTR | Yes | 1.00E-26 | 95 | |
| C0780 | c | 434 | 3381930 | 3382134 | 204 | mdh | argR | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 22618 | Yes | 3.00E-06 | 100 | ||
| C0783 | c | 430 | 3389663 | 3390084 | 421 | tldD | yhdP | 2;8;12 | 2932 | 5UTR | Yes | 3.00E-08 | 95 | ORF 288 |
| C0787 | c | 151 | 3400983 | 3401110 | 127 | yhdA | yhdH | 2;12 | 1701 | Yes | 1.00E-07 | 83 | ||
| C0788 | w | 151 | 3401034 | 3401085 | 51 | yhdA | yhdH | 2;8;10;12 | 411 | Yes | 0.0006 | 100 | ||
| C0789 | w | 818 | 3402775 | 3403065 | 290 | b3254 | accB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4201 | Yes | 5.00E-21 | 96 | ||
| C0790 | w | 537 | 3416663 | 3416777 | 114 | yhdV | yhdW | 2 | 974 | 5UTR | 0.099 | 100 | ||
| C0803 | c | 237 | 3450938 | 3451108 | 170 | rpsJ | pinO | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 16520 | 5UTR | Yes | 3.00E-55 | 93 | |
| C0810 | c | 220 | 3475065 | 3475161 | 96 | fkpA | slyX | 2;4;8 | 1531 | Yes | 4.00E-10 | 88 | ORF 87 | |
| C0811 | w | 220 | 3475115 | 3475275 | 160 | fkpA | slyX | 1;2;3;4;5;8;9;10;11 | 1545 | 5UTR | Yes | 5.00E-20 | 89 | ORF 87 |
| C0813 | c | 127 | 3478801 | 3478883 | 82 | yheR | yheS | 12 | 989 | Yes | 7.00E-05 | 89 | ||
| crpT | c | 301 | 3483455 | 3483551 | 96 | yhfA | crp | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2607 | 5UTR | Yes | 9.00E-14 | 98 | crpT (sRNA) / ORF 87 |
| C0816 | w | 301 | 3483589 | 3483741 | 152 | yhfA | crp | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13378 | Yes | 4.00E-17 | 94 | ||
| C0819 | c | 508 | 3509763 | 3509982 | 219 | yhfZ | trpS | 3;11 | 8557 | 0.2 | 100 | ORF 126 | ||
| C0823 | c | 199 | 3516903 | 3517023 | 120 | aroK | hofQ | 2;7;8;10;11;13 | 1704 | Yes | 0.0004 | 100 | ||
| C0825 | w | 319 | 3523961 | 3524099 | 138 | yrfE | yrfF | 12 | 912 | Yes | 1.00E-20 | 88 | ||
| C0827 | w | 454 | 3537716 | 3537788 | 72 | yhgF | feoA | 2;3;5;8;9;10;11;12 | 8127 | 0.23 | 100 | |||
| C0828 | c | 611 | 3550124 | 3550234 | 110 | malP | malT | 2;8;10;11;12 | 1475 | Yes | 3.00E-20 | 89 | ||
| C0829 | w | 611 | 3550540 | 3550716 | 176 | malP | malT | 2;3 | 1101 | Yes | 1.00E-14 | 83 | ||
| C0833 | c | 192 | 3572517 | 3572612 | 95 | asd | yhgN | 2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 20315 | Yes | 4.00E-16 | 96 | ||
| C0837 | c | 423 | 3595191 | 3595353 | 162 | livK | yhhK | 1;2;3;5;8;9;11 | 1853 | 5UTR | Yes | 0.0002 | 93 | ORF 144 |
| C0839 | c | 244 | 3598422 | 3598624 | 202 | rpoH | ftsX | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 4712 | Yes | 9.00E-16 | 81 | Reg AraC | |
| C0844 | c | 365 | 3628232 | 3628426 | 194 | yhiI | yhiJ | 2;8;12 | 1404 | Yes | 2.00E-10 | 97 | ORF 159 | |
| C0845 | w | 231 | 3635075 | 3635270 | 195 | yhiN | pitA | 1;2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4189 | Yes | 1.00E-36 | 99 | ||
| C0848 | c | 390 | 3637396 | 3637469 | 73 | yhiO | uspA | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12 | 14957 | 5UTR | 0.059 | 100 | ||
| C0849 | w | 390 | 3637567 | 3637737 | 170 | yhiO | uspA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 14455 | 5UTR | Yes | 2.00E-10 | 91 | |
| C0858 | w | 798 | 3655514 | 3655994 | 480 | hdeD | yhiE | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 7555 | 5UTR | 0.45 | 100 | Reg Crp | |
| C0862 | c | 367 | 3662482 | 3662530 | 48 | yhiW | yhiX | 12 | 521 | 2.2 | 100 | |||
| C0863 | c | 369 | 3663490 | 3663797 | 307 | yhiX | gadA | 12 | 2724 | 5UTR | 0.29 | 100 | ORF 183 | |
| C0867 | c | 272 | 3693817 | 3693940 | 123 | yhjR | yhjS | 2;8 | 2272 | 0.11 | 100 | ORF 102 | ||
| C0870 | c | 910 | 3705334 | 3705491 | 157 | dppA | proK | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13165 | Yes | 2.00E-07 | 97 | ||
| C0873 | w | 151 | 3710601 | 3710719 | 118 | yhjY | tag | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 1353 | Yes | 4.00E-07 | 88 | ||
| C0874 | w | 313 | 3717032 | 3717104 | 72 | yiaF | yiaG | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 6432 | 5UTR | Yes | 7.00E-14 | 91 | |
| C0875 | w | 280 | 3717510 | 3717661 | 151 | yiaG | cspA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 17508 | Yes | 4.00E-48 | 92 | ||
| C0884 | c | 79 | 3780189 | 3780265 | 76 | cysE | gpsA | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2050 | 5UTR | 0.24 | 100 | ||
| C0886 | c | 141 | 3782086 | 3782208 | 122 | grxC | yibN | 2;3;8;12 | 5015 | 5UTR | 0.42 | 100 | ||
| C0889 | c | 274 | 3790178 | 3790214 | 36 | kbl | htrL | 2;3;5;8;12;13 | 1760 | Yes | 4.00E-10 | 95 | ||
| C0890 | w | 288 | 3791564 | 3791612 | 48 | htrL | rfaD | 2;3;7;8;12 | 1251 | 5UTR | Yes | 2.00E-09 | 90 | |
| C0892 | c | 441 | 3805725 | 3805899 | 174 | rfaQ | kdtA | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 1701 | Yes | 5.00E-20 | 84 | ||
| C0897 | c | 279 | 3826323 | 3826404 | 81 | gltS | yicE | 1;2;8;11;12 | 767 | 0.017 | 100 | ORF 102 | ||
| C0902 | c | 230 | 3865049 | 3865148 | 99 | ibpA | yidQ | 2;4;7;8;10;12 | 5102 | 5UTR | Yes | 2.00E-18 | 92 | |
| C0903 | c | 607 | 3881357 | 3881580 | 223 | dnaA | rpmH | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2714 | Yes | 5.00E-36 | 92 | ||
| C0904 | w | 607 | 3881691 | 3881962 | 271 | dnaA | rpmH | 2;3;4;7;8;12;13 | 4317 | Yes | 1.00E-30 | 100 | ||
| C0913 | c | 604 | 3920080 | 3920271 | 191 | atpI | gidB | 2;8 | 3420 | 5UTR | Yes | 7.00E-75 | 98 | |
| C0919 | c | 624 | 3938806 | 3939018 | 212 | yieP | rrsC | 2;3;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2960 | Yes | 1.00E-27 | 82 | ||
| C0925 | w | 365 | 3988410 | 3988760 | 350 | hemC | cyaA | 2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9397 | 5UTR | Yes | 6.00E-43 | 99 | |
| C0926 | w | 423 | 3992194 | 3992370 | 176 | b3808 | dapF | 2;7;12;13 | 4389 | Yes | 5.00E-20 | 83 | ||
| C0927 | w | 369 | 3998669 | 3999035 | 366 | yigE | corA | 2;11;12;13 | 6112 | Yes | e-120 | 95 | ||
| C0929 | w | 236 | 4010458 | 4010617 | 159 | metR | metE | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12 | 18693 | Yes | 2.00E-13 | 100 | ORF 108 | |
| C0930 | w | 298 | 4013780 | 4014016 | 236 | ysgA | udp | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 11986 | Yes | 4.00E-15 | 93 | ||
| C0931 | w | 140 | 4014880 | 4014910 | 30 | udp | yigN | 1;2;3;5;8;11;12;13 | 1131 | 5UTR | 0.07 | 100 | ||
| C0939 | w | 182 | 4049491 | 4049617 | 126 | yihI | hemN | 2;4;11;12;13 | 750 | Yes | 4.00E-23 | 94 | ||
| C0942 | c | 372 | 4055614 | 4055791 | 177 | glnA | yihK | 1;2;3;5;8;9;10;11;12;13 | 10374 | 5UTR | Yes | 1.00E-48 | 91 | |
| C0946 | c | 193 | 4083406 | 4083537 | 131 | fdoG | fdhD | 2;5;11;12;13 | 4606 | 5UTR | Yes | 1.00E-16 | 89 | |
| C0949 | c | 146 | 4103251 | 4103382 | 131 | cpxR | b3913 | 2;5;7;8;9;10;11;12 | 1569 | Yes | 1.00E-56 | 95 | ||
| C0951 | w | 180 | 4104968 | 4105130 | 162 | yiiP | pfkA | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 4130 | 5UTR | Yes | 3.00E-49 | 91 | |
| C0956 | w | 424 | 4115914 | 4116093 | 179 | glpF | yiiU | 2;3;4;8;9;10;11;12 | 3376 | Yes | 3.00E-06 | 82 | ||
| C0957 | c | 424 | 4116009 | 4116081 | 72 | glpF | yiiU | 2;3;4;5;13 | 1692 | 0.058 | 100 | |||
| C0958 | w | 202 | 4124432 | 4124585 | 153 | priA | rpmE | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9191 | 5UTR | Yes | 1.00E-20 | 96 | |
| C0961 | c | 597 | 4150685 | 4150869 | 184 | ppc | argE | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 5249 | Yes | 5.00E-17 | 90 | ORF 126 | |
| C0962 | w | 153 | 4152484 | 4152573 | 89 | argE | argC | 2;3;4;8;11 | 3885 | 0.019 | 100 | |||
| C0965 | w | 368 | 4160972 | 4161216 | 244 | trmA | btuB | 2;7;8;11;13 | 2163 | 5UTR | Yes | 5.00E-36 | 93 | |
| C0979 | c | 232 | 4193677 | 4193889 | 212 | thiC | yjaE | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11 | 10129 | 5UTR | Yes | 1.00E-27 | 95 | |
| C0982 | w | 268 | 4212974 | 4213055 | 81 | metA | aceB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13178 | Yes | 1.00E-09 | 84 | ||
| C0985 | w | 219 | 4225184 | 4225294 | 110 | metH | yjbB | 2 | 679 | 0.024 | 100 | |||
| C0987 | c | 524 | 4230812 | 4231191 | 379 | lysC | pgi | 1;2;3;5;7;8;9;11;12 | 4741 | 5UTR | 0.36 | 89 | ||
| C0988 | w | 524 | 4230934 | 4231006 | 72 | lysC | pgi | 2;3;4;7;12;13 | 914 | 5UTR | 0.9 | 100 | ORF 135 | |
| C0992 | c | 110 | 4254105 | 4254189 | 84 | plsB | dgkA | 2;8;9;11;12;13 | 2261 | 1.1 | 100 | |||
| C0993 | w | 110 | 4254106 | 4254208 | 102 | plsB | dgkA | 2;3;8 | 1103 | 0.022 | 92 | |||
| C0994 | w | 115 | 4256724 | 4256814 | 90 | dinF | yjbJ | 2;3;4;5;7;8;10;12 | 5699 | 5UTR | 0.075 | 100 | ||
| C0997 | w | 545 | 4275907 | 4276056 | 149 | soxR | yjcD | 2;7;8;11;12 | 1018 | Yes | 2.00E-13 | 95 | ||
| C1000 | w | 392 | 4285271 | 4285341 | 70 | acs | nrfA | 2;12 | 2110 | 5UTR | 0.056 | 95 | ORF 78 | |
| C1001 | w | 341 | 4291972 | 4292058 | 86 | nrfG | gltP | 2;3;8;11;12 | 1667 | Yes | 0.005 | 88 | ||
| C1004 | c | 400 | 4324312 | 4324400 | 88 | phnA | yjdA | 2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1432 | Yes | 1.00E-18 | 93 | ||
| C1006 | w | 263 | 4327908 | 4328078 | 170 | yjcZ | proP | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4607 | Yes | 1.00E-11 | 87 | ||
| C1014 | c | 236 | 4352300 | 4352378 | 78 | lysU | yjdL | 2;3;7;8;12;13 | 6246 | 5UTR | 3.9 | 100 | ||
| C1015 | w | 390 | 4366217 | 4366327 | 110 | aspA | b4140 | 4;8 | 1028 | 5UTR | Yes | 7.00E-09 | 83 | |
| C1016 | w | 275 | 4368190 | 4368264 | 74 | yjeH | mopB | 1;2;3;4;5;6;7;8;10;11;12;13 | 16199 | 5UTR | Yes | 3.00E-13 | 87 | |
| C1019 | w | 459 | 4374084 | 4374301 | 217 | efp | sugE | 2;4;10 | 4612 | Yes | 4.00E-27 | 83 | ||
| C1020 | c | 294 | 4379911 | 4379995 | 84 | frdA | yjeA | 2;5 | 1062 | 0.018 | 100 | |||
| C1021 | c | 96 | 4387939 | 4388033 | 94 | psd | yjeQ | 2;3;5;7;8;11;12;13 | 2433 | 5UTR | Yes | 8.00E-05 | 100 | |
| C1022 | w | 210 | 4389730 | 4389914 | 184 | yjeR | glyV | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12 | 8655 | 5UTR | Yes | 8.00E-19 | 100 | |
| C1033 | w | 326 | 4422598 | 4422694 | 96 | yjfY | rpsF | 1;2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 15358 | 5UTR | Yes | 3.00E-38 | 95 | |
| C1037 | w | 189 | 4434216 | 4434331 | 115 | cpdB | cysQ | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12 | 2233 | Yes | 3.00E-08 | 87 | ORF 75 | |
| C1038 | c | 285 | 4436840 | 4436939 | 99 | ytfJ | ytfK | 2;3;4;13 | 811 | Yes | 9.00E-05 | 87 | ||
| C1039 | w | 285 | 4436895 | 4437119 | 224 | ytfJ | ytfK | 3;4 | 7298 | Yes | 5.00E-05 | 83 | ||
| C1040 | c | 205 | 4439753 | 4439837 | 84 | msrA | ytfM | 2;3;4;8;10;11;12;13 | 2316 | Yes | 3.00E-07 | 89 | ORF 78 | |
| C1044 | c | 93 | 4455453 | 4455525 | 72 | yjgA | pmbA | 3 | 1543 | 5UTR | Yes | 6.00E-36 | 100 | |
| C1049 | c | 393 | 4460245 | 4460362 | 117 | nrdD | treC | 4;10;13 | 14094 | 5UTR | Yes | 7.00E-06 | 96 | ORF 120 |
| C1054 | c | 130 | 4470783 | 4470864 | 81 | yjgH | yjgI | 3;10 | 1945 | 0.26 | 100 | |||
| C1057 | c | 266 | 4483519 | 4483702 | 183 | pepA | yjgP | 2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 | 1696 | Yes | 5.00E-54 | 94 | ORF 96 | |
| C1058 | w | 266 | 4483629 | 4483772 | 143 | pepA | yjgP | 2;3;4;8;10;12;13 | 1599 | Yes | 2.00E-53 | 95 | ||
| C1060 | w | 260 | 4494236 | 4494314 | 78 | leuX | intB | 2;3;4;8;10;12 | 1939 | 0.99 | 100 | |||
| C1064 | w | 291 | 4515937 | 4516032 | 95 | fecI | insA | 2 | 779 | 0.32 | 100 | |||
| C1065 | c | 291 | 4515947 | 4516093 | 146 | fecI | insA | 3;7 | 572 | 0.51 | 100 | Reg IHF | ||
| C1071 | c | 1446 | 4537102 | 4537476 | 374 | yjhA | fimB | 13 | 893 | 5UTR | 0.089 | 100 | ||
| C1072 | w | 481 | 4540547 | 4540664 | 117 | fimE | fimA | 1;2;3;5;6;7;8;9;11;12;13 | 8589 | 0.4 | 100 | |||
| C1076 | w | 663 | 4554221 | 4554286 | 65 | yjiC | yjiD | 4;11 | 2402 | 5UTR | 0.2 | 100 | Reg IlvY | |
| C1084 | c | 292 | 4596975 | 4597063 | 88 | mdoB | yjjA | 2;8;10 | 1372 | 1.1 | 100 | |||
| C1086 | c | 137 | 4599519 | 4599629 | 110 | yjjB | yjjP | 8 | 1254 | Yes | 0.006 | 90 | ||
| C1089 | w | 392 | 4608719 | 4608955 | 236 | prfC | osmY | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12 | 20142 | 5UTR | Yes | 3.00E-13 | 96 | |
| C1092 | w | 257 | 4614665 | 4614890 | 225 | yjjI | deoC | 2;8;12 | 2077 | Yes | 6.00E-17 | 85 | ||
| C1100 | c | 95 | 4637875 | 4637965 | 90 | arcA | yjjY | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 9859 | Yes | 8.00E-42 | 98 | ||
| C1101 | w | 95 | 4637879 | 4637964 | 85 | arcA | yjjY | 2;4;12 | 2415 | Yes | 7.00E-39 | 98 |