Transcript Name |
Strand |
Ig Size (nt) |
From (bp) |
To (bp) |
Size (nt) |
Left Gene |
Right Gene |
Experiments |
Expression |
Cluster |
Homology |
E-value |
Identity (%) |
Information |
C0006 |
w |
146 |
15300 |
15378 |
78 |
dnaJ |
gef |
1;2;3;4;7;8;9;10;11;13 |
2871 |
|
|
0.99 |
100 |
C0008 |
w |
190 |
19663 |
19807 |
144 |
nhaR |
rpsT |
2;3;12; |
732 |
3UTR |
|
0.13 |
100 |
C0009 |
c |
306 |
20547 |
20794 |
247 |
nhaR |
rpsT |
1;2;3;4;6;7;8;9;11;12;13; |
16183 |
3UTR |
|
0.23 |
100 |
C0020 |
w |
407 |
59316 |
59470 |
154 |
yabQ |
yabO |
2;3;4;8;11 |
724 |
|
|
0.14 |
100 |
C0021 |
c |
407 |
59568 |
59665 |
97 |
yabQ |
yabO |
3 |
464 |
|
|
0.32 |
100 |
C0022 |
c |
164 |
63315 |
63413 |
98 |
hepA |
polB |
4;7;10;11;12 |
1200 |
|
Yes |
6.00E-18 |
89 |
C0024 |
w |
85 |
71273 |
71343 |
70 |
araC |
yabI |
2;4;12 |
1044 |
|
|
0.056 |
100 |
C0025 |
c |
113 |
72115 |
72192 |
77 |
yabI |
yabJ |
1;2;3;4;7;11;12; |
1488 |
3UTR |
Yes |
3.00E-13 |
97 |
C0026 |
w |
113 |
72115 |
72190 |
75 |
yabI |
yabJ |
"1;2;3;4;7;11;12," |
1611 |
|
Yes |
3.00E-13 |
97 |
C0040 |
w |
157 |
173452 |
173557 |
105 |
fhuB |
hemL |
1;2;3;5;7;8;9;11;12;13 |
1412 |
|
Yes |
0.006 |
95 |
C0079 |
w |
247 |
302905 |
303051 |
146 |
yagU |
ykgJ |
2;3 |
909 |
3UTR |
|
0.51 |
100 |
C0080 |
c |
174 |
311567 |
311727 |
160 |
ykgL |
ykgM |
2;3;4;5; |
14080 |
3UTR |
Yes |
2.00E-13 |
83 |
C0098 |
w |
127 |
444400 |
444487 |
87 |
yajQ |
yajR |
1;2;3;7;8;9;11;13 |
1053 |
|
|
0.072 |
89 |
C0110 |
w |
211 |
489134 |
489167 |
33 |
aefA |
ybaM |
2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
4524 |
|
|
5 |
100 |
C0117 |
w |
235 |
497046 |
497143 |
97 |
adk |
hemH |
2;3;7;8;12 |
1225 |
|
|
0.082 |
95 |
C0119 |
c |
132 |
500653 |
500783 |
130 |
gsk |
ybaL |
1;2;3;4;7;8;9;10;11;12 |
1739 |
|
Yes |
5.00E-07 |
97 |
C0124 |
c |
194 |
550561 |
550747 |
186 |
arcC |
purK |
12 |
604 |
|
Yes |
2.00E-10 |
95 |
C0133 |
c |
281 |
608580 |
608678 |
98 |
ybdK |
entD |
1;2;3;7;8;11; |
2442 |
3UTR |
|
0.083 |
100 |
C0145 |
w |
80 |
642552 |
642622 |
70 |
ybdR |
b0609 |
2;4;5;6;7;8;10;11;12 |
1447 |
|
|
0.22 |
100 |
C0158 |
c |
169 |
685919 |
686028 |
109 |
gltJ |
ybeJ |
8;12 |
1401 |
|
Yes |
8.00E-24 |
92 |
C0185 |
w |
157 |
785919 |
786017 |
98 |
aroG |
gpmA |
2;8;11; |
1013 |
3UTR |
Yes |
0.005 |
92 |
C0186 |
c |
157 |
785960 |
786038 |
78 |
aroG |
gpmA |
8 |
580 |
3UTR |
Yes |
0.004 |
92 |
C0193 |
c |
228 |
836689 |
836774 |
85 |
ybiC |
ybiJ |
2;4 |
1654 |
|
|
0.28 |
87 |
C0231 |
w |
129 |
963341 |
963420 |
79 |
himD |
ycaI |
2;3 |
1207 |
|
Yes |
0.004 |
89 |
C0237 |
w |
221 |
983542 |
983719 |
177 |
ycbL |
aspC |
3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
1843 |
|
Yes |
4.00E-08 |
97 |
ORF 78 |
C0261 |
c |
151 |
1061622 |
1061749 |
127 |
torD |
yccD |
12 |
1631 |
|
Yes |
5.00E-07 |
97 |
C0264 |
w |
362 |
1067399 |
1067717 |
318 |
ycdF |
ycdG |
4;7;8;10 |
15891 |
3UTR |
Yes |
1.00E-09 |
89 |
C0266 |
w |
533 |
1080108 |
1080346 |
238 |
putP |
b1016 |
11 |
3463 |
|
|
0.22 |
100 |
C0277 |
c |
111 |
1145135 |
1145232 |
97 |
yceC |
yceF |
2;3;4;7;8;10 |
1309 |
|
Yes |
2.00E-05 |
93 |
C0286 |
w |
399 |
1164952 |
1165052 |
100 |
ycfP |
ndh |
2;3;5;11;12 |
618 |
|
Yes |
0.0003 |
94 |
C0289 |
c |
168 |
1189706 |
1189829 |
123 |
phoP |
purB |
1;2;3;7;8 |
2918 |
|
Yes |
0.007 |
100 |
ORF 81 |
C0302 |
c |
220 |
1241256 |
1241379 |
123 |
b1191 |
b1192 |
2;8 |
1293 |
|
|
0.027 |
100 |
C0303 |
c |
116 |
1257068 |
1257140 |
72 |
ychF |
pth |
2;7;11 |
2356 |
|
Yes |
3.00E-19 |
93 |
C0310 |
w |
1729 |
1268265 |
1269970 |
1705 |
kdsA |
chaA |
2;3;6;7;8;9;10;11;12;13 |
1579 |
|
Yes |
7.00E-43 |
85 |
C0319 |
c |
247 |
1294586 |
1294658 |
72 |
b1240 |
adhE |
2;13 |
610 |
|
|
0.23 |
100 |
C0331 |
c |
125 |
1341020 |
1341123 |
103 |
yciH |
osmB |
2;3;4;7;8;10;12 |
12277 |
3UTR |
|
0.35 |
100 |
C0336 |
c |
312 |
1355181 |
1355444 |
263 |
sapA |
ymjA |
2;7;8;11;12 |
2372 |
|
|
0.016 |
95 |
C0344 |
c |
128 |
1408943 |
1409016 |
73 |
dbpA |
ydaO |
2;5;11;12 |
1603 |
|
Yes |
0.0002 |
89 |
C0351 |
w |
244 |
1489516 |
1489596 |
80 |
cybB |
ydcA |
2;3;7;8;9;10;11;12;13 |
1017 |
|
Yes |
2.00E-11 |
92 |
ORF 93 |
C0359 |
w |
112 |
1522419 |
1522503 |
84 |
b1452 |
ansP |
2;3;7;8;9;11 |
2794 |
3UTR |
|
0.27 |
100 |
C0379 |
c |
678 |
1639084 |
1639176 |
92 |
b1556 |
cspB |
2;10;11;13 |
633 |
|
|
0.077 |
100 |
C0381 |
w |
421 |
1640102 |
1640390 |
288 |
cspF |
b1559 |
2;8 |
1370 |
3UTR |
|
1.1 |
100 |
C0383 |
c |
307 |
1642551 |
1642636 |
85 |
b1560 |
rem |
2;4 |
1182 |
|
|
0.28 |
95 |
C0384 |
c |
216 |
1642999 |
1643116 |
117 |
rem |
relF |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
4665 |
|
|
0.1 |
100 |
ORF 96 |
C0393 |
w |
396 |
1669010 |
1669143 |
133 |
ynfM |
asr |
2;3 |
667 |
|
|
0.46 |
100 |
C0397 |
w |
225 |
1689385 |
1689509 |
124 |
ydgA |
uidC |
2;12 |
915 |
|
Yes |
3.00E-08 |
97 |
C0405 |
w |
161 |
1734028 |
1734113 |
85 |
sodB |
b1657 |
12;13 |
2741 |
3UTR |
Yes |
2.00E-05 |
91 |
C0427 |
w |
229 |
1821316 |
1821507 |
191 |
nadE |
b1741 |
1;2;3;7;8;9;10;11;12;13 |
649 |
|
Yes |
0.003 |
96 |
C0431 |
c |
89 |
1863669 |
1863747 |
78 |
b1781 |
yeaF |
2;8;10;12;13 |
841 |
|
|
0.064 |
100 |
C0439 |
c |
165 |
1905169 |
1905242 |
73 |
yebH |
cspC |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
13331 |
|
|
3.6 |
100 |
C0449 |
c |
326 |
1927899 |
1928042 |
143 |
yebE |
yebF |
2;3;4;7;8;9;10;11;12 |
3151 |
|
|
0.032 |
95 |
C0455 |
w |
130 |
1937143 |
1937220 |
77 |
pykA |
msbB |
2;8;11;12;13 |
1105 |
3UTR |
|
0.063 |
100 |
C0458 |
w |
146 |
1942225 |
1942312 |
87 |
yebI |
ruvB |
2 |
1237 |
|
Yes |
2.00E-05 |
96 |
C0482 |
w |
312 |
2040070 |
2040262 |
192 |
b1973 |
yodB |
1;2;3;4;5 |
5917 |
|
|
2.7 |
100 |
C0490 |
c |
197 |
2078674 |
2078793 |
119 |
yeeA |
sbmC |
2;4;10;11;12 |
617 |
3UTR |
|
0.41 |
100 |
C0498 |
w |
108 |
2144605 |
2144687 |
82 |
yegE |
alkA |
8;9;10;12 |
1966 |
|
Yes |
2.00E-05 |
92 |
er38 |
c |
301 |
2175361 |
2175530 |
169 |
gatY |
fbaB |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
7907 |
3UTR |
Yes |
4.00E-05 |
97 |
C0508 |
c |
129 |
2224403 |
2224527 |
124 |
yohD |
yohF |
2;4;8;10;12 |
3343 |
|
Yes |
0.0004 |
100 |
C0512 |
w |
129 |
2229750 |
2229844 |
94 |
yohK |
cdd |
2 |
2077 |
|
Yes |
2.00E-05 |
84 |
C0514 |
c |
242 |
2234592 |
2234754 |
162 |
yeiA |
mglC |
13 |
880 |
|
Yes |
6.00E-10 |
97 |
C0520 |
c |
422 |
2257651 |
2257733 |
82 |
yeiC |
fruA |
4;11 |
974 |
|
|
0.067 |
100 |
C0525 |
c |
138 |
2280880 |
2280957 |
77 |
rplY |
yejK |
2;3 |
441 |
|
Yes |
7.00E-08 |
97 |
C0528 |
w |
199 |
2314873 |
2314957 |
84 |
rcsB |
rcsC |
2;3;4;7;8;11;12 |
1119 |
|
Yes |
3.00E-10 |
97 |
ORF 93 |
C0532 |
w |
238 |
2355875 |
2356037 |
162 |
yfaD |
b2245 |
11 |
1244 |
|
|
0.14 |
100 |
C0533 |
w |
238 |
2355875 |
2356037 |
162 |
yfaD |
b2245 |
11 |
1244 |
|
|
0.14 |
100 |
C0534 |
c |
238 |
2355965 |
2356057 |
92 |
yfaD |
b2245 |
1 |
921 |
|
|
0.077 |
100 |
C0549 |
c |
196 |
2421595 |
2421722 |
127 |
yfcI |
hisP |
2 |
784 |
|
|
1.7 |
100 |
C0558 |
c |
264 |
2438321 |
2438403 |
82 |
b2322 |
fabB |
1;2;3;5;8;9;10;11;12;13 |
3247 |
|
|
0.27 |
100 |
C0559 |
c |
120 |
2441882 |
2441908 |
26 |
b2324 |
b2325 |
1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 |
680 |
|
|
0.21 |
100 |
C0562 |
c |
202 |
2454888 |
2455027 |
139 |
b2340 |
b2341 |
2;4;5;8;10 |
2866 |
|
Yes |
1.00E-35 |
99 |
C0584 |
c |
188 |
2536503 |
2536686 |
183 |
b2420 |
cysM |
2;8;11;12; |
3597 |
3UTR |
Yes |
2.00E-10 |
97 |
C0588 |
c |
303 |
2541669 |
2541844 |
175 |
cysP |
ucpA |
13 |
474 |
3UTR |
Yes |
1.00E-32 |
90 |
C0589 |
w |
239 |
2547444 |
2547528 |
84 |
b2430 |
b2431 |
2;8;12;13 |
9144 |
|
Yes |
7.00E-08 |
97 |
C0596 |
w |
94 |
2579661 |
2579752 |
91 |
tktB |
b2466 |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
5681 |
|
Yes |
1.00E-06 |
95 |
C0597 |
c |
94 |
2579661 |
2579749 |
88 |
tktB |
b2466 |
7 |
1870 |
|
Yes |
1.00E-06 |
95 |
C0626 |
c |
694 |
2698252 |
2698348 |
96 |
yfhL |
acpS |
2;3;5 |
1227 |
|
|
1.3 |
100 |
C0639 |
w |
103 |
2735520 |
2735596 |
76 |
yfiA |
pheL |
1;2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 |
4012 |
|
Yes |
9.00E-29 |
96 |
C0646 |
w |
205 |
2753981 |
2754094 |
113 |
ssrA |
intA |
2;3;7;8;9;10;11;12;13 |
1158 |
|
Yes |
0.0001 |
91 |
C0647 |
c |
359 |
2763222 |
2763442 |
220 |
yfjL |
yfjM |
2 |
1710 |
|
Yes |
0.0002 |
89 |
C0656 |
w |
191 |
2806172 |
2806263 |
91 |
proX |
b2680 |
2;8;7 |
427 |
3UTR |
Yes |
2.00E-05 |
90 |
ORF 150 |
C0665 |
c |
152 |
2835460 |
2835590 |
130 |
hypF |
hydN |
6;7 |
1336 |
3UTR |
|
1.8 |
100 |
C0683 |
c |
350 |
2940669 |
2940908 |
239 |
gcvA |
b2809 |
7;12 |
1092 |
|
Yes |
e-110 |
96 |
ORF 102 |
C0685 |
c |
238 |
2943944 |
2944085 |
141 |
ygdL |
mltA |
2;11 |
1047 |
|
Yes |
6.00E-10 |
97 |
C0694 |
c |
195 |
3040313 |
3040507 |
194 |
ygfZ |
b2899 |
5;10;11; |
1109 |
|
Yes |
3.00E-06 |
93 |
C0695 |
w |
195 |
3040319 |
3040507 |
188 |
ygfZ |
b2899 |
12 |
544 |
|
Yes |
3.00E-06 |
93 |
C0707 |
w |
205 |
3080693 |
3080718 |
25 |
yggG |
speB |
1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 |
1084 |
3UTR |
|
3.1 |
100 |
C0708 |
c |
205 |
3080737 |
3080893 |
156 |
yggG |
speB |
3;8;12 |
608 |
|
Yes |
2.00E-06 |
96 |
C0711 |
w |
183 |
3091942 |
3092038 |
96 |
yqgF |
yggR |
1;2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13; |
6794 |
3UTR |
Yes |
0.001 |
94 |
C0733 |
w |
180 |
3200771 |
3200949 |
178 |
cca |
bacA |
11;12 |
1053 |
|
Yes |
2.00E-07 |
95 |
C0746 |
w |
133 |
3252882 |
3252974 |
92 |
yhaL |
yhaM |
2;3;4;8;9;12 |
847 |
3UTR |
|
0.02 |
100 |
C0748 |
w |
113 |
3294627 |
3294698 |
71 |
yraP |
yraQ |
2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
7986 |
|
Yes |
2.00E-14 |
98 |
C0749 |
w |
117 |
3302106 |
3302197 |
91 |
yhbW |
mtr |
12 |
1499 |
|
Yes |
2.00E-05 |
96 |
C0767 |
c |
126 |
3330390 |
3330496 |
106 |
yhbE |
rpmA |
2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 |
1784 |
|
Yes |
1.00E-13 |
94 |
C0830 |
w |
205 |
3561151 |
3561348 |
197 |
glpD |
yzgL |
2;5;12;13 |
2190 |
|
Yes |
2.00E-07 |
97 |
C0838 |
c |
187 |
3596050 |
3596175 |
125 |
yhhK |
livJ |
2;3;5;8;9;11 |
1453 |
|
Yes |
2.00E-09 |
97 |
C0841 |
w |
101 |
3606281 |
3606377 |
96 |
zntA |
yhhP |
2;3;4;7;8;11;12 |
877 |
|
|
0.081 |
95 |
C0842 |
c |
101 |
3606289 |
3606379 |
90 |
zntA |
yhhP |
7 |
658 |
|
|
0.075 |
95 |
C0847 |
c |
243 |
3636771 |
3637013 |
242 |
pitA |
yhiO |
1;2;3;4;8;9;10;11;12; |
11953 |
3UTR |
Yes |
1.00E-09 |
97 |
C0852 |
w |
155 |
3652180 |
3652265 |
85 |
slp |
yhiF |
12 |
507 |
|
|
1.1 |
100 |
C0860 |
c |
362 |
3661214 |
3661501 |
287 |
yhiV |
yhiW |
12 |
2866 |
3UTR |
|
1.1 |
100 |
C0882 |
w |
505 |
3773881 |
3773957 |
76 |
mtlR |
yibL |
4 |
525 |
|
|
0.24 |
100 |
ORF 207 |
C0883 |
w |
197 |
3778684 |
3778819 |
135 |
lldD |
yibK |
12 |
1113 |
3UTR |
|
0.47 |
100 |
C0933 |
w |
380 |
4024837 |
4025164 |
327 |
ubiB |
fadA |
2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13; |
4692 |
3UTR |
Yes |
1.00E-09 |
97 |
C0938 |
c |
125 |
4047622 |
4047707 |
85 |
spf |
yihA |
2;3;4;5;8;10;11;12;13 |
1339 |
|
|
0.018 |
100 |
C0941 |
c |
285 |
4053965 |
4054188 |
223 |
glnL |
glnA |
2;11;12;13 |
4705 |
|
Yes |
2.00E-07 |
95 |
C0944 |
c |
329 |
4077767 |
4077844 |
77 |
yiiF |
fdhE |
1;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 |
1070 |
3UTR |
|
0.98 |
100 |
ORF 90 |
C0953 |
w |
319 |
4106109 |
4106289 |
180 |
pfkA |
sbp |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
4732 |
|
Yes |
1.00E-08 |
97 |
C0954 |
c |
134 |
4113162 |
4113291 |
129 |
glpX |
glpK |
5;13 |
1939 |
|
Yes |
8.00E-09 |
88 |
C0960 |
c |
214 |
4145951 |
4146103 |
152 |
yijO |
yijP |
2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
4919 |
|
Yes |
1.00E-07 |
100 |
C0975 |
c |
409 |
4187910 |
4188286 |
376 |
htrC |
thiH |
1;2;3;5;7;8;9;10;11 |
2606 |
|
|
0.023 |
100 |
C1007 |
c |
176 |
4329582 |
4329754 |
172 |
proP |
basS |
2;4;8;11; |
813 |
3UTR |
Yes |
7.00E-07 |
90 |
C1008 |
w |
176 |
4329583 |
4329757 |
174 |
proP |
basS |
2;3;7;8;12 |
2058 |
|
Yes |
7.00E-07 |
90 |
C1013 |
c |
319 |
4350696 |
4350768 |
72 |
yjdK |
lysU |
12 |
318 |
|
|
0.9 |
100 |
C1018 |
w |
202 |
4370743 |
4370938 |
195 |
yjeI |
yjeJ |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
2037 |
|
Yes |
3.00E-09 |
97 |
ORF 102 |
C1030 |
w |
116 |
4413483 |
4413593 |
110 |
aidB |
yjfN |
2;3;4;8;9;10;11;12; |
2507 |
|
Yes |
6.00E-06 |
92 |
C1031 |
c |
116 |
4413516 |
4413592 |
76 |
aidB |
yjfN |
2;3;4 |
1078 |
|
Yes |
4.00E-06 |
92 |
C1043 |
c |
155 |
4454738 |
4454883 |
145 |
yjfG |
yjgA |
1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 |
1585 |
|
Yes |
1.00E-10 |
97 |
C1052 |
c |
205 |
4467904 |
4468099 |
195 |
mgtA |
yjgF |
2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13; |
4544 |
3UTR |
Yes |
8.00E-07 |
97 |
C1059 |
c |
160 |
4486019 |
4486127 |
108 |
yjgQ |
yjgR |
4 |
1103 |
|
|
0.093 |
100 |
C1096 |
w |
307 |
4626126 |
4626265 |
139 |
nadR |
yjjK |
3;8;9;12 |
1128 |
|
|
0.49 |
95 |
ORF 105 |
C1097 |
c |
146 |
4630669 |
4630773 |
104 |
trpR |
yjjX |
2 |
7814 |
|
Yes |
1.00E-07 |
95 |
C1098 |
w |
146 |
4630670 |
4630749 |
79 |
trpR |
yjjX |
12 |
411 |
|
Yes |
7.00E-08 |
95 |