| Transcript Name | Strand | Ig Size (nt) | From (bp) | To (bp) | Size (nt) | Left Gene | Right Gene | Experiments | Expression | Cluster | Homology | E-value | Identity (%) | Information |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C0006 | w | 146 | 15300 | 15378 | 78 | dnaJ | gef | 1;2;3;4;7;8;9;10;11;13 | 2871 | 0.99 | 100 | |||
| C0008 | w | 190 | 19663 | 19807 | 144 | nhaR | rpsT | 2;3;12; | 732 | 3UTR | 0.13 | 100 | ||
| C0009 | c | 306 | 20547 | 20794 | 247 | nhaR | rpsT | 1;2;3;4;6;7;8;9;11;12;13; | 16183 | 3UTR | 0.23 | 100 | ||
| C0020 | w | 407 | 59316 | 59470 | 154 | yabQ | yabO | 2;3;4;8;11 | 724 | 0.14 | 100 | |||
| C0021 | c | 407 | 59568 | 59665 | 97 | yabQ | yabO | 3 | 464 | 0.32 | 100 | |||
| C0022 | c | 164 | 63315 | 63413 | 98 | hepA | polB | 4;7;10;11;12 | 1200 | Yes | 6.00E-18 | 89 | ||
| C0024 | w | 85 | 71273 | 71343 | 70 | araC | yabI | 2;4;12 | 1044 | 0.056 | 100 | |||
| C0025 | c | 113 | 72115 | 72192 | 77 | yabI | yabJ | 1;2;3;4;7;11;12; | 1488 | 3UTR | Yes | 3.00E-13 | 97 | |
| C0026 | w | 113 | 72115 | 72190 | 75 | yabI | yabJ | "1;2;3;4;7;11;12," | 1611 | Yes | 3.00E-13 | 97 | ||
| C0040 | w | 157 | 173452 | 173557 | 105 | fhuB | hemL | 1;2;3;5;7;8;9;11;12;13 | 1412 | Yes | 0.006 | 95 | ||
| C0079 | w | 247 | 302905 | 303051 | 146 | yagU | ykgJ | 2;3 | 909 | 3UTR | 0.51 | 100 | ||
| C0080 | c | 174 | 311567 | 311727 | 160 | ykgL | ykgM | 2;3;4;5; | 14080 | 3UTR | Yes | 2.00E-13 | 83 | |
| C0098 | w | 127 | 444400 | 444487 | 87 | yajQ | yajR | 1;2;3;7;8;9;11;13 | 1053 | 0.072 | 89 | |||
| C0110 | w | 211 | 489134 | 489167 | 33 | aefA | ybaM | 2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4524 | 5 | 100 | |||
| C0117 | w | 235 | 497046 | 497143 | 97 | adk | hemH | 2;3;7;8;12 | 1225 | 0.082 | 95 | |||
| C0119 | c | 132 | 500653 | 500783 | 130 | gsk | ybaL | 1;2;3;4;7;8;9;10;11;12 | 1739 | Yes | 5.00E-07 | 97 | ||
| C0124 | c | 194 | 550561 | 550747 | 186 | arcC | purK | 12 | 604 | Yes | 2.00E-10 | 95 | ||
| C0133 | c | 281 | 608580 | 608678 | 98 | ybdK | entD | 1;2;3;7;8;11; | 2442 | 3UTR | 0.083 | 100 | ||
| C0145 | w | 80 | 642552 | 642622 | 70 | ybdR | b0609 | 2;4;5;6;7;8;10;11;12 | 1447 | 0.22 | 100 | |||
| C0158 | c | 169 | 685919 | 686028 | 109 | gltJ | ybeJ | 8;12 | 1401 | Yes | 8.00E-24 | 92 | ||
| C0185 | w | 157 | 785919 | 786017 | 98 | aroG | gpmA | 2;8;11; | 1013 | 3UTR | Yes | 0.005 | 92 | |
| C0186 | c | 157 | 785960 | 786038 | 78 | aroG | gpmA | 8 | 580 | 3UTR | Yes | 0.004 | 92 | |
| C0193 | c | 228 | 836689 | 836774 | 85 | ybiC | ybiJ | 2;4 | 1654 | 0.28 | 87 | |||
| C0231 | w | 129 | 963341 | 963420 | 79 | himD | ycaI | 2;3 | 1207 | Yes | 0.004 | 89 | ||
| C0237 | w | 221 | 983542 | 983719 | 177 | ycbL | aspC | 3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1843 | Yes | 4.00E-08 | 97 | ORF 78 | |
| C0261 | c | 151 | 1061622 | 1061749 | 127 | torD | yccD | 12 | 1631 | Yes | 5.00E-07 | 97 | ||
| C0264 | w | 362 | 1067399 | 1067717 | 318 | ycdF | ycdG | 4;7;8;10 | 15891 | 3UTR | Yes | 1.00E-09 | 89 | |
| C0266 | w | 533 | 1080108 | 1080346 | 238 | putP | b1016 | 11 | 3463 | 0.22 | 100 | |||
| C0277 | c | 111 | 1145135 | 1145232 | 97 | yceC | yceF | 2;3;4;7;8;10 | 1309 | Yes | 2.00E-05 | 93 | ||
| C0286 | w | 399 | 1164952 | 1165052 | 100 | ycfP | ndh | 2;3;5;11;12 | 618 | Yes | 0.0003 | 94 | ||
| C0289 | c | 168 | 1189706 | 1189829 | 123 | phoP | purB | 1;2;3;7;8 | 2918 | Yes | 0.007 | 100 | ORF 81 | |
| C0302 | c | 220 | 1241256 | 1241379 | 123 | b1191 | b1192 | 2;8 | 1293 | 0.027 | 100 | |||
| C0303 | c | 116 | 1257068 | 1257140 | 72 | ychF | pth | 2;7;11 | 2356 | Yes | 3.00E-19 | 93 | ||
| C0310 | w | 1729 | 1268265 | 1269970 | 1705 | kdsA | chaA | 2;3;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1579 | Yes | 7.00E-43 | 85 | ||
| C0319 | c | 247 | 1294586 | 1294658 | 72 | b1240 | adhE | 2;13 | 610 | 0.23 | 100 | |||
| C0331 | c | 125 | 1341020 | 1341123 | 103 | yciH | osmB | 2;3;4;7;8;10;12 | 12277 | 3UTR | 0.35 | 100 | ||
| C0336 | c | 312 | 1355181 | 1355444 | 263 | sapA | ymjA | 2;7;8;11;12 | 2372 | 0.016 | 95 | |||
| C0344 | c | 128 | 1408943 | 1409016 | 73 | dbpA | ydaO | 2;5;11;12 | 1603 | Yes | 0.0002 | 89 | ||
| C0351 | w | 244 | 1489516 | 1489596 | 80 | cybB | ydcA | 2;3;7;8;9;10;11;12;13 | 1017 | Yes | 2.00E-11 | 92 | ORF 93 | |
| C0359 | w | 112 | 1522419 | 1522503 | 84 | b1452 | ansP | 2;3;7;8;9;11 | 2794 | 3UTR | 0.27 | 100 | ||
| C0379 | c | 678 | 1639084 | 1639176 | 92 | b1556 | cspB | 2;10;11;13 | 633 | 0.077 | 100 | |||
| C0381 | w | 421 | 1640102 | 1640390 | 288 | cspF | b1559 | 2;8 | 1370 | 3UTR | 1.1 | 100 | ||
| C0383 | c | 307 | 1642551 | 1642636 | 85 | b1560 | rem | 2;4 | 1182 | 0.28 | 95 | |||
| C0384 | c | 216 | 1642999 | 1643116 | 117 | rem | relF | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4665 | 0.1 | 100 | ORF 96 | ||
| C0393 | w | 396 | 1669010 | 1669143 | 133 | ynfM | asr | 2;3 | 667 | 0.46 | 100 | |||
| C0397 | w | 225 | 1689385 | 1689509 | 124 | ydgA | uidC | 2;12 | 915 | Yes | 3.00E-08 | 97 | ||
| C0405 | w | 161 | 1734028 | 1734113 | 85 | sodB | b1657 | 12;13 | 2741 | 3UTR | Yes | 2.00E-05 | 91 | |
| C0427 | w | 229 | 1821316 | 1821507 | 191 | nadE | b1741 | 1;2;3;7;8;9;10;11;12;13 | 649 | Yes | 0.003 | 96 | ||
| C0431 | c | 89 | 1863669 | 1863747 | 78 | b1781 | yeaF | 2;8;10;12;13 | 841 | 0.064 | 100 | |||
| C0439 | c | 165 | 1905169 | 1905242 | 73 | yebH | cspC | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 13331 | 3.6 | 100 | |||
| C0449 | c | 326 | 1927899 | 1928042 | 143 | yebE | yebF | 2;3;4;7;8;9;10;11;12 | 3151 | 0.032 | 95 | |||
| C0455 | w | 130 | 1937143 | 1937220 | 77 | pykA | msbB | 2;8;11;12;13 | 1105 | 3UTR | 0.063 | 100 | ||
| C0458 | w | 146 | 1942225 | 1942312 | 87 | yebI | ruvB | 2 | 1237 | Yes | 2.00E-05 | 96 | ||
| C0482 | w | 312 | 2040070 | 2040262 | 192 | b1973 | yodB | 1;2;3;4;5 | 5917 | 2.7 | 100 | |||
| C0490 | c | 197 | 2078674 | 2078793 | 119 | yeeA | sbmC | 2;4;10;11;12 | 617 | 3UTR | 0.41 | 100 | ||
| C0498 | w | 108 | 2144605 | 2144687 | 82 | yegE | alkA | 8;9;10;12 | 1966 | Yes | 2.00E-05 | 92 | ||
| er38 | c | 301 | 2175361 | 2175530 | 169 | gatY | fbaB | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 7907 | 3UTR | Yes | 4.00E-05 | 97 | |
| C0508 | c | 129 | 2224403 | 2224527 | 124 | yohD | yohF | 2;4;8;10;12 | 3343 | Yes | 0.0004 | 100 | ||
| C0512 | w | 129 | 2229750 | 2229844 | 94 | yohK | cdd | 2 | 2077 | Yes | 2.00E-05 | 84 | ||
| C0514 | c | 242 | 2234592 | 2234754 | 162 | yeiA | mglC | 13 | 880 | Yes | 6.00E-10 | 97 | ||
| C0520 | c | 422 | 2257651 | 2257733 | 82 | yeiC | fruA | 4;11 | 974 | 0.067 | 100 | |||
| C0525 | c | 138 | 2280880 | 2280957 | 77 | rplY | yejK | 2;3 | 441 | Yes | 7.00E-08 | 97 | ||
| C0528 | w | 199 | 2314873 | 2314957 | 84 | rcsB | rcsC | 2;3;4;7;8;11;12 | 1119 | Yes | 3.00E-10 | 97 | ORF 93 | |
| C0532 | w | 238 | 2355875 | 2356037 | 162 | yfaD | b2245 | 11 | 1244 | 0.14 | 100 | |||
| C0533 | w | 238 | 2355875 | 2356037 | 162 | yfaD | b2245 | 11 | 1244 | 0.14 | 100 | |||
| C0534 | c | 238 | 2355965 | 2356057 | 92 | yfaD | b2245 | 1 | 921 | 0.077 | 100 | |||
| C0549 | c | 196 | 2421595 | 2421722 | 127 | yfcI | hisP | 2 | 784 | 1.7 | 100 | |||
| C0558 | c | 264 | 2438321 | 2438403 | 82 | b2322 | fabB | 1;2;3;5;8;9;10;11;12;13 | 3247 | 0.27 | 100 | |||
| C0559 | c | 120 | 2441882 | 2441908 | 26 | b2324 | b2325 | 1;2;3;5;7;8;9;10;11;12;13 | 680 | 0.21 | 100 | |||
| C0562 | c | 202 | 2454888 | 2455027 | 139 | b2340 | b2341 | 2;4;5;8;10 | 2866 | Yes | 1.00E-35 | 99 | ||
| C0584 | c | 188 | 2536503 | 2536686 | 183 | b2420 | cysM | 2;8;11;12; | 3597 | 3UTR | Yes | 2.00E-10 | 97 | |
| C0588 | c | 303 | 2541669 | 2541844 | 175 | cysP | ucpA | 13 | 474 | 3UTR | Yes | 1.00E-32 | 90 | |
| C0589 | w | 239 | 2547444 | 2547528 | 84 | b2430 | b2431 | 2;8;12;13 | 9144 | Yes | 7.00E-08 | 97 | ||
| C0596 | w | 94 | 2579661 | 2579752 | 91 | tktB | b2466 | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 5681 | Yes | 1.00E-06 | 95 | ||
| C0597 | c | 94 | 2579661 | 2579749 | 88 | tktB | b2466 | 7 | 1870 | Yes | 1.00E-06 | 95 | ||
| C0626 | c | 694 | 2698252 | 2698348 | 96 | yfhL | acpS | 2;3;5 | 1227 | 1.3 | 100 | |||
| C0639 | w | 103 | 2735520 | 2735596 | 76 | yfiA | pheL | 1;2;3;4;5;8;9;10;11;12;13 | 4012 | Yes | 9.00E-29 | 96 | ||
| C0646 | w | 205 | 2753981 | 2754094 | 113 | ssrA | intA | 2;3;7;8;9;10;11;12;13 | 1158 | Yes | 0.0001 | 91 | ||
| C0647 | c | 359 | 2763222 | 2763442 | 220 | yfjL | yfjM | 2 | 1710 | Yes | 0.0002 | 89 | ||
| C0656 | w | 191 | 2806172 | 2806263 | 91 | proX | b2680 | 2;8;7 | 427 | 3UTR | Yes | 2.00E-05 | 90 | ORF 150 |
| C0665 | c | 152 | 2835460 | 2835590 | 130 | hypF | hydN | 6;7 | 1336 | 3UTR | 1.8 | 100 | ||
| C0683 | c | 350 | 2940669 | 2940908 | 239 | gcvA | b2809 | 7;12 | 1092 | Yes | e-110 | 96 | ORF 102 | |
| C0685 | c | 238 | 2943944 | 2944085 | 141 | ygdL | mltA | 2;11 | 1047 | Yes | 6.00E-10 | 97 | ||
| C0694 | c | 195 | 3040313 | 3040507 | 194 | ygfZ | b2899 | 5;10;11; | 1109 | Yes | 3.00E-06 | 93 | ||
| C0695 | w | 195 | 3040319 | 3040507 | 188 | ygfZ | b2899 | 12 | 544 | Yes | 3.00E-06 | 93 | ||
| C0707 | w | 205 | 3080693 | 3080718 | 25 | yggG | speB | 1;2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 1084 | 3UTR | 3.1 | 100 | ||
| C0708 | c | 205 | 3080737 | 3080893 | 156 | yggG | speB | 3;8;12 | 608 | Yes | 2.00E-06 | 96 | ||
| C0711 | w | 183 | 3091942 | 3092038 | 96 | yqgF | yggR | 1;2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13; | 6794 | 3UTR | Yes | 0.001 | 94 | |
| C0733 | w | 180 | 3200771 | 3200949 | 178 | cca | bacA | 11;12 | 1053 | Yes | 2.00E-07 | 95 | ||
| C0746 | w | 133 | 3252882 | 3252974 | 92 | yhaL | yhaM | 2;3;4;8;9;12 | 847 | 3UTR | 0.02 | 100 | ||
| C0748 | w | 113 | 3294627 | 3294698 | 71 | yraP | yraQ | 2;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 7986 | Yes | 2.00E-14 | 98 | ||
| C0749 | w | 117 | 3302106 | 3302197 | 91 | yhbW | mtr | 12 | 1499 | Yes | 2.00E-05 | 96 | ||
| C0767 | c | 126 | 3330390 | 3330496 | 106 | yhbE | rpmA | 2;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 1784 | Yes | 1.00E-13 | 94 | ||
| C0830 | w | 205 | 3561151 | 3561348 | 197 | glpD | yzgL | 2;5;12;13 | 2190 | Yes | 2.00E-07 | 97 | ||
| C0838 | c | 187 | 3596050 | 3596175 | 125 | yhhK | livJ | 2;3;5;8;9;11 | 1453 | Yes | 2.00E-09 | 97 | ||
| C0841 | w | 101 | 3606281 | 3606377 | 96 | zntA | yhhP | 2;3;4;7;8;11;12 | 877 | 0.081 | 95 | |||
| C0842 | c | 101 | 3606289 | 3606379 | 90 | zntA | yhhP | 7 | 658 | 0.075 | 95 | |||
| C0847 | c | 243 | 3636771 | 3637013 | 242 | pitA | yhiO | 1;2;3;4;8;9;10;11;12; | 11953 | 3UTR | Yes | 1.00E-09 | 97 | |
| C0852 | w | 155 | 3652180 | 3652265 | 85 | slp | yhiF | 12 | 507 | 1.1 | 100 | |||
| C0860 | c | 362 | 3661214 | 3661501 | 287 | yhiV | yhiW | 12 | 2866 | 3UTR | 1.1 | 100 | ||
| C0882 | w | 505 | 3773881 | 3773957 | 76 | mtlR | yibL | 4 | 525 | 0.24 | 100 | ORF 207 | ||
| C0883 | w | 197 | 3778684 | 3778819 | 135 | lldD | yibK | 12 | 1113 | 3UTR | 0.47 | 100 | ||
| C0933 | w | 380 | 4024837 | 4025164 | 327 | ubiB | fadA | 2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13; | 4692 | 3UTR | Yes | 1.00E-09 | 97 | |
| C0938 | c | 125 | 4047622 | 4047707 | 85 | spf | yihA | 2;3;4;5;8;10;11;12;13 | 1339 | 0.018 | 100 | |||
| C0941 | c | 285 | 4053965 | 4054188 | 223 | glnL | glnA | 2;11;12;13 | 4705 | Yes | 2.00E-07 | 95 | ||
| C0944 | c | 329 | 4077767 | 4077844 | 77 | yiiF | fdhE | 1;3;4;5;7;8;9;10;11;12;13 | 1070 | 3UTR | 0.98 | 100 | ORF 90 | |
| C0953 | w | 319 | 4106109 | 4106289 | 180 | pfkA | sbp | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4732 | Yes | 1.00E-08 | 97 | ||
| C0954 | c | 134 | 4113162 | 4113291 | 129 | glpX | glpK | 5;13 | 1939 | Yes | 8.00E-09 | 88 | ||
| C0960 | c | 214 | 4145951 | 4146103 | 152 | yijO | yijP | 2;3;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 4919 | Yes | 1.00E-07 | 100 | ||
| C0975 | c | 409 | 4187910 | 4188286 | 376 | htrC | thiH | 1;2;3;5;7;8;9;10;11 | 2606 | 0.023 | 100 | |||
| C1007 | c | 176 | 4329582 | 4329754 | 172 | proP | basS | 2;4;8;11; | 813 | 3UTR | Yes | 7.00E-07 | 90 | |
| C1008 | w | 176 | 4329583 | 4329757 | 174 | proP | basS | 2;3;7;8;12 | 2058 | Yes | 7.00E-07 | 90 | ||
| C1013 | c | 319 | 4350696 | 4350768 | 72 | yjdK | lysU | 12 | 318 | 0.9 | 100 | |||
| C1018 | w | 202 | 4370743 | 4370938 | 195 | yjeI | yjeJ | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 2037 | Yes | 3.00E-09 | 97 | ORF 102 | |
| C1030 | w | 116 | 4413483 | 4413593 | 110 | aidB | yjfN | 2;3;4;8;9;10;11;12; | 2507 | Yes | 6.00E-06 | 92 | ||
| C1031 | c | 116 | 4413516 | 4413592 | 76 | aidB | yjfN | 2;3;4 | 1078 | Yes | 4.00E-06 | 92 | ||
| C1043 | c | 155 | 4454738 | 4454883 | 145 | yjfG | yjgA | 1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13 | 1585 | Yes | 1.00E-10 | 97 | ||
| C1052 | c | 205 | 4467904 | 4468099 | 195 | mgtA | yjgF | 2;3;4;6;7;8;9;10;11;12;13; | 4544 | 3UTR | Yes | 8.00E-07 | 97 | |
| C1059 | c | 160 | 4486019 | 4486127 | 108 | yjgQ | yjgR | 4 | 1103 | 0.093 | 100 | |||
| C1096 | w | 307 | 4626126 | 4626265 | 139 | nadR | yjjK | 3;8;9;12 | 1128 | 0.49 | 95 | ORF 105 | ||
| C1097 | c | 146 | 4630669 | 4630773 | 104 | trpR | yjjX | 2 | 7814 | Yes | 1.00E-07 | 95 | ||
| C1098 | w | 146 | 4630670 | 4630749 | 79 | trpR | yjjX | 12 | 411 | Yes | 7.00E-08 | 95 |